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[Gaussian/gview] Fe掺杂UiO-66-NH2,使用Gaussian构型优化问题

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首先,我的团簇为金属簇加周围的配体,末端使用对苯二甲酸饱和,使用Gaussian对其进行构型优化,以下是我的优化gif文件,请大佬帮我检查一下如此写法可否计算,
按照sob老师赝势基组的教程学习写的。


Fe.gjf

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优化上传文件

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发表于 Post on 2026-1-3 12:31:20 | 只看该作者 Only view this author
以后提到我的博文/帖子的时候必须主动给出链接,假定你说的是
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html

关键词写法无误
强烈建议用PBE0代替B3LYP,下文说了
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html

我不知道你的初始结构怎么来的,很诡异。输入文件里原子键长普遍太长,可能导致SCF收敛困难。一些原子位置也明显不合适,比如H207

输入文件里只给了4核,算这个根本算不动,算到猴年马月去。4GB内存也根本不够

这不是容易SCF收敛的体系,始终用#P便于监控


你这个体系大概率还是有磁性特征的体系,当闭壳层计算也不合理。如果你是初学者,不建议上来就算这玩意。下文建议看了
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2026-1-3 19:04:37 | 只看该作者 Only view this author
先不说能否收敛的问题,Gaussian4核算这个根本没法算呀

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-4 09:20:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-1-3 12:31
以后提到我的博文/帖子的时候必须主动给出链接,假定你说的是
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势 ...

谢谢老师提醒,发帖规则我会再去学习。
这个结构是我在CCDC下载的晶体文件,然后再去MS取一簇,并使用DMol3进行初步优化后得到的结构,我的结构如附件。
这个核数和内存我没有改过来,我在去学校超算会改多。
您的意思是,我这个结构建模本身有问题,所以可能会出现SCF收敛困难,我昨天算之后,的确出现报错,报错内容为Convergence failure --run terminated.,
我在想是不是像您说的,这种我需要去计算自旋极化单重态。然后重新建模,才可以优化出来。

Fe.mol

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-4 09:22:30 | 只看该作者 Only view this author
dylanx 发表于 2026-1-3 19:04
先不说能否收敛的问题,Gaussian4核算这个根本没法算呀

这个我还没有改过来,我在算的时候会改,主要是带不同金属之后,计算更容易出问题

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发表于 Post on 2026-1-4 23:11:13 | 只看该作者 Only view this author
小松鼠ddd 发表于 2026-1-4 09:20
谢谢老师提醒,发帖规则我会再去学习。
这个结构是我在CCDC下载的晶体文件,然后再去MS取一簇,并使用DM ...

用Dmol3预优化纯属多余

建模是建模,SCF是SCF,完全是两码事
先确保初始几何结构没明显硬伤,然后才是说经过SCF算能量/受力、进一步优化结构的事
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