大共轭体系分子结构优化前预优化方法选择问题

sgwzq

lhchem 发表于 2026-8-28 19:38
请问老师，我看您关于molclus的博文里面提到：对于柔性分子体系，需要得到这些低能量极小点的结构和出现 ...

一个分子不是只有一种构象。如果两种以上构象能量相近，实际的体系很可能是共存的。一般可以用玻尔兹曼分布的配分函数公式计算百分比。构象搜索是做这个用的。

因为几何优化只是能通过类似牛顿-拉弗森法（不断地求导数，或者叫梯度）得到该构型附近，各原子受力（导数）为零的构型。如果一个函数有很多极值点，你无法保证优化好的极值就是所有构象中最小的那一个。构象搜索的意思就是产生很多很多个初始构型，尽可能多地找出极值点的位置。

所以说如果不确定构象的话，几乎是必须要做构象搜索和几何优化的。

sobereva

lhchem 发表于 2026-8-28 19:38
请问老师，我看您关于molclus的博文里面提到：对于柔性分子体系，需要得到这些低能量极小点的结构和出现 ...

你可以先对基态用molclus做构象搜索得到能量最低构象，以其为初始结构优化S1，得到的S1极小点很可能就是实际发荧光对应的结构。但也不排除激发态势能面和基态的相差太大，导致S1势能面上另有能量更低的极小点结构，届时至于荧光从S1具体哪个结构发的，还会牵扯到激发态动力学，就比较复杂了。建议先姑且先把基态的构象搜索做了