jmol的使用问题

lujun · 发表于 Post on 2017-5-6 11:40:23

各位大神：
有没有谁对jmol软件很熟悉。我现在要画一个结构，用jmol画。由于分子里面有两个原子隔得有一点远，现在需要把这两个原子用键连起来，方便观察结构。jmol没法像gauss那样直接操作，不知道大家有没有什么比较好的方法？
谢谢大家！

fhh2626 · 发表于 Post on 2017-5-6 11:56:07

你用别的软件画好再用jmol打开不就行了？

sobereva · 发表于 Post on 2017-5-6 12:16:12

jmol用的人极少
如果你非要用jmol来显示，可以其它程序画好，连上键，然后保存成带有连接关系的文件格式比如mol2（jmol是否支持此格式我不知道）
要么干脆就别用jmol

nusiew · 发表于 Post on 2022-2-15 16:45:25

sobereva 发表于 2017-5-6 12:16
jmol用的人极少
如果你非要用jmol来显示，可以其它程序画好，连上键，然后保存成带有连接关系的文件格式比 ...

支持mol2格式，Jmol支持的格式见链接 http://jmol.sourceforge.net/

granvia · 发表于 Post on 2022-2-15 18:20:29

假设两个原子的编号是11和12号，则打开控制台，输入：

复制代码

如果想用双键连接，则用“connect double”。三键用“triple”，氢键用“hbond”

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[综合交流] jmol的使用问题