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[Material Studio] 求助MS中GULP模块的ReaxFF力场去模拟煤的低温氧化计算RDF没有峰怎么办

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用MS的GULP模块的ReaxFF力场进行分子动力学模拟煤的低温氧化,以下是我的具体操作,具体操作步骤如下,请帮我看一下这个模拟思路有问题没?还有一些具体的问题,求帮忙解答,谢谢。
1.导入实验数据构建的煤分子结构,进行COMPASS力场来进行一个简单的几何优化。



2.使用AC模块的COMPASS力场进行盒子的构建,图中是一些参数设置。


3.对构建的盒子取10帧中能量最低的一个,保存为.xsd文件在GULP模块中进行ReaxFF力场的几何优化。



4.在GULP中进行Anneal退火操作,以下是设置的参数。

5.使用GULP模块进行MD模拟,以下是设置的参数。

6.取出.xtd文件标记氧气分子和煤分子中的羰基,进行下一步的RDF分析。

7.使用脚本文件进行RDF扩散系数的计算,但是对于这个分析结果,总是没有所谓第一配位峰和第二配位峰,这个问题应该如何解决?

以下是脚本文件的参数设置,还有跑出来的RDF分析。脚本参数中截断距离为RDF_cut  =  13,Interval = 0.05。

请各位老师帮忙看看我的这个操作有没有问题,这个峰的问题应该如何解决?









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2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-13 18:08:38 | 只看该作者 Only view this author
是不是对于RDF分析的对象选择错误呀

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