计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 51|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 我想用Gaussian做个bomd,各位老师,同学能帮我看看吗?

[复制链接 Copy URL]

9

帖子

0

威望

39

eV
积分
48

Level 2 能力者

各位老师同学好,我做吸附氢分子,想看它在300k能不能释放,77k稳不稳定
我的gif文件开头是
%nprocshared=16
%mem=2000MB
#p wb97xd/6-31++g(2d,2p) nosymm
bomd=(update=5,maxpoints=10000,stepsize=10000,rtemp=300,readstop)


我的问题是
Maxpoints=10000 每个轨迹的最大步数

Stepsize=10000  是 10000*0.0001=1fs  相当于 步长为1fs

总的就是10000fs =10 ps

RTemp=300这个就是温度300k

ReadStop 读入另外的停止标准(我这个后面没有跟什么内容,是不是跑到最大步数就停止了呀?或者是我直接不加)

update=5 BOMD默认在每一个点进行二阶求导,使用Update关键词会使程序在计算新的Hessian之前,在n个梯度点上更新hessian。GradientOnly定义只做梯度计算,并且总是更新hessian(不计算完全的二阶微分)。ReCalcFC是该选项的同义词,我不太明白这个

NTraj=N 计算N个轨迹  我这个没有是不是不加也没有关系呢?

算出log文件是不是在log中  例如Predicted information for step  19415 这个地方去找每步的能量









gif文件截图.png (23.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

gjf的输入截图

gjf的输入截图

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124691

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on yesterday 14:55 | 只看该作者 Only view this author
除非你要做准经典动力学,否则建议用ORCA做MD,明显易用,看
使用ORCA做从头算动力学(AIMD)的简单例子
http://sobereva.com/576http://bbs.keinsci.com/thread-20800-1-1.html

PS:Gaussian、ORCA、xtb做动力学的方法在北京科音高级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KAQC)里有极为全面系统、掰开了揉碎了的讲授,如果学一遍在AIMD方面就精通了,并且你问的这些问题也就一次性全都明白了

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-25 03:10 , Processed in 0.188261 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list