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[GROMACS] 请教1000ns后蛋白金属体系是否平衡

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如图所示,横坐标是800-1000ns,纵坐标分别是三个指标:蛋白质RMSD、蛋白质Rg、蛋白质内部氢键,请问第一个体系和第二个体系收敛了吗?第一个体系RMSD最后有上升的趋势,但是Rg和内部氢键收敛了,这个体系可以认为是收敛的吗?

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发表于 Post on 2026-1-27 15:51:41 | 只看该作者 Only view this author
要看体系及目的,不能一概而论 。
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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发表于 Post on 2026-1-28 16:55:13 | 只看该作者 Only view this author
参考
谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡
http://sobereva.com/627http://bbs.keinsci.com/thread-27122-1-1.html
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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