如何利用Gaussian计算二维晶体中片段的能量

柠夏七开 · 发表于 Post on 2026-1-30 10:26:58

老师们好，我想研究的一个二维晶体存在许多化学式相同，但是转角不同的层，想研究不同转角的相邻两层的能量（主要是为了研究不同相邻层的能量差异随着转角变化）。我将晶体的CIF文件转为.mol文件以后，再利用GV转为.gjf文件。
因为认为转角主要和pai-pai相互作用有关，从而引发了能量的不同，所以单独把CIF文件中配体部分的数据（键长、层间距等）截留到GV中然后进行计算。由于没有了金属中心，配体带有电荷，我人为添加了甲基使整个体系不带电，再进行先执行优化优化甲基算单点能。
求评估这样的作法是否合理，还是应该用cp2k等第一性原理做计算（但是苦于不知道应该进行什么类型的计算才能得到相邻两层的能量）。不胜感激

UW_0728. · 发表于 Post on 2026-1-30 18:53:36

这条博文也许有用：

使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685

sobereva · 发表于 Post on 2026-2-2 07:10:22

没有具体体系结构，没法准确说怎么计算和分析讨论合理。文字描述过于抽象，体系的基本特征都尚且不知

那叫pi-pi不叫pai-pai

把下文看了可能对理解此问题很有益
谈谈pi-pi相互作用
http://sobereva.com/737（http://bbs.keinsci.com/thread-51636-1-1.html）

柠夏七开 · 发表于 Post on 2026-2-2 09:26:57

UW_0728. 发表于 2026-1-30 18:53
这条博文也许有用：

使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析

感谢

柠夏七开 · 发表于 Post on 2026-2-2 09:27:41

sobereva 发表于 2026-2-2 07:10
没有具体体系结构，没法准确说怎么计算和分析讨论合理。文字描述过于抽象，体系的基本特征都尚且不知

那 ...

好的，谢谢老师

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