求助：填充水后，gmx grompp因体系带8个电荷的报错的处理

charmm36 · 发表于 Post on 2026-2-10 13:26:24

我用gromacs做MD加完水后，运行gmx grompp因体系带8个电荷而终止，使用-maxwarn 1后正常运行，再通过gmx genion加抗衡离子后，不需要去掉-maxwarn 1重新执行前面的gmx grompp吧？后面可直接能量最小化吗？

KanbeKotori · 发表于 Post on 2026-2-10 14:16:16

不需要，没加抗衡离子之前带电太正常了。你之后需要带着你加了抗衡离子的电中性体系对应的结构和拓扑文件跑最小化和md就好了。

charmm36 · 发表于 Post on 2026-2-10 14:24:32

KanbeKotori 发表于 2026-2-10 14:16
不需要，没加抗衡离子之前带电太正常了。你之后需要带着你加了抗衡离子的电中性体系对应的结构和拓扑文件跑 ...

好的，谢谢

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[GROMACS] 求助：填充水后，gmx grompp因体系带8个电荷的报错的处理