sobtop将Se元素识别成ss原子类型的问题

知食分子 · 发表于 Post on 2026-2-14 15:30:58

本帖最后由知食分子于 2026-2-14 16:00 编辑

指认原子类型的过程中，选择的是优先指认Gaff原子类型然后再指认UFF力场原子类型，但是sobtop会将Se元素识别成GAFF力场的ss原子类型，而不是UFF力场的UF_Se原子类型。请问这种情况如何把Se的原子类型手动改过来？
13S : ss       Sp3 S in thio-ester and thio-ether
14C : c2       Sp2 C
15C : c2       Sp2 C
16C : c2       Sp2 C
17C : c2       Sp2 C
18Se: ss       Sp3 S in thio-ester and thio-ether

KazusaT · 发表于 Post on 2026-2-14 16:21:33

6 Manually set atom type for selected atoms

知食分子 · 发表于 Post on 2026-2-14 18:54:36

KazusaT 发表于 2026-2-14 16:21
6 Manually set atom type for selected atoms

非常感谢，我试试！

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