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[综合讨论] 求助,请问基于第一激发态的轨迹跑非绝热动力学,会有怎么样的效果呢?

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大家好,如题。
我目前在尝试生成金刚烷团簇第一激发态(S₁)的分子动力学轨迹,计划用于后续的非绝热动力学计算。在 CP2K 中进行 300 K、NVT 条件下的激发态 MD 时,发现体系温度难以维持在设定的 300 K。由于势能向动能的快速转换,温度在初始阶段迅速升高至约 500 K,并在该温度附近稳定约 1 ps;但在继续推进动力学时,温度又出现明显波动。对于更大的体系,温度甚至可能升至 ~1000 K。
我想请教:
  • 若激发态 MD 稳定段温度显著高于设定温度(如 ~500 K),这样的轨迹是否仍具有物理意义,可用于后续非绝热相关分析(例如抽取约 1000 帧构型进行 TDDFT 计算,用于非绝热耦合的统计)?
  • 在实际研究中,是否有工作采用激发态 MD 轨迹作为后续非绝热动力学的结构来源?这种策略是否是常见做法?
  • 考虑到激发态轨迹计算成本较高且平稳段较短,这种基于激发态预平衡轨迹进行统计采样的方法在实践中是否可行,或是否有更推荐的标准流程?


欢迎大家指教,谢谢!

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发表于 Post on 前天 07:32 | 只看该作者 Only view this author
我感觉你说的这段轨迹类似预平衡过程,从远离当前势能面极小点的位置跑到接近当前势能面极小点的位置,所以势能下降,转化为动能。我个人感觉是,你可以先在激发态下做结构优化,需要的步数应该会比 MD 预平衡少得多,计算效率更高。抛砖引玉,还请大佬指正。
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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 楼主 Author| 发表于 Post on 前天 09:28 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2026-2-19 07:32
我感觉你说的这段轨迹类似预平衡过程,从远离当前势能面极小点的位置跑到接近当前势能面极小点的位置,所以 ...

谢谢老师的建议!

我在 CP2K 中使用杂化泛函进行第一激发态(TDDFT)结构优化时,发现激发态梯度计算阶段内存占用显著增加,经常出现 OOM(out of memory)报错。相比单点计算,结构优化过程中资源需求明显更高。

请问老师是否有相关经验,或者在方法设置和并行方式上有什么建议,可以帮助降低内存占用、避免 OOM 的情况?

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发表于 Post on 前天 14:31 | 只看该作者 Only view this author
不会扣篮的后卫 发表于 2026-2-19 09:28
谢谢老师的建议!

我在 CP2K 中使用杂化泛函进行第一激发态(TDDFT)结构优化时,发现激发态梯度计算 ...

这个我不太懂,但是动力学也要计算原子受力(能量对坐标的梯度)的,这一点跟结构优化并没有区别
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on yesterday 07:57 | 只看该作者 Only view this author
单个金刚烷的动力学用Gaussian或ORCA等量子化学程序远比CP2K更适合
金刚烷的S1是里德堡态,电子分布十分弥散,CP2K里你得用相当大的盒子,用CP2K跑这东西很吃亏
而且CP2K的TDDFT激发态优化功能不如Gaussian的鲁棒
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on yesterday 12:09 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2026-2-19 14:31
这个我不太懂,但是动力学也要计算原子受力(能量对坐标的梯度)的,这一点跟结构优化并没有区别

谢谢陶老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on yesterday 12:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-2-20 07:57
单个金刚烷的动力学用Gaussian或ORCA等量子化学程序远比CP2K更适合
金刚烷的S1是里德堡态,电子分布十分弥 ...

谢谢卢老师!

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