AIM分析和RDG分析判断氢键是否存在的标准为什么不一样？

sobereva · 发表于 Post on 2020-11-19 05:36:04

SSSjjjiao 发表于 2020-11-18 15:07
老师，我想问一下：
我的体系IGM分析时，有CH-pi ,pi-pi, lp-pi 等相互作用，但是AIM分析的时候这种又相 ...

那个公式只适用于普通氢键

有对应pi作用的键径并没什么问题。比如此文里RDG图和pi-pi的键径图一起给出
全面探究18碳环独特的分子间相互作用与pi-pi堆积特征
http://sobereva.com/572（http://bbs.keinsci.com/thread-19660-1-1.html）
倘若你确实不需要对应pi的键径和BCP，也不需要自行ps，可以搜索完了再用Multiwfn里的选项删掉它们，或者你可以只搜索对应氢键的BCP，选项1 Search CPs from given starting points里可以指定以两个原子间的中点为初猜搜索CP。

chenchen0119 · 发表于 Post on 2021-11-15 15:58:07

本帖最后由 chenchen0119 于 2021-11-15 16:48 编辑

sob老师，AIM计算，我的氢键是O-H...O但是ρ=0.045-0.068a.u. ∇2ρ=0. 15-0.21,这还属于氢键吗？有什么论据没有，您的那篇论文我没有找到相关依据

虎王 · 发表于 Post on 2021-11-17 15:51:06

kevin 发表于 2017-5-14 09:37
请问sob老师，都有哪些氢键判断标准呢？

本质上是判断有没作用以及作用强弱。氢键不是像共价作用、静电作用、色散作用这样的基本作用，程序应该不能直接判断有没氢键。应该是判断某处有足够强的吸引，然后人们根据结构特点判定是氢键还是pi-pi堆积之类的。

sobereva · 发表于 Post on 2021-12-3 04:20:00

chenchen0119 发表于 2021-11-15 15:58
sob老师，AIM计算，我的氢键是O-H...O但是ρ=0.045-0.068a.u. ∇2ρ=0. 15-0.21,这还属于氢键吗？有 ...

有什么理由不是氢键？你都知道这是O-H...O典型的氢键结构特征，而且BCP电子密度还那么大，不是氢键是什么？通过下文方法都可以估计出来这个氢键强度已经算是挺强的了
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度：一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513（http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html）

研究问题不要太教条。有基本化学常识就能很准确判断的东西完全没必要非要找别人提出的什么判据、标准来支持

以后如果想让我回复，点击我回帖下面的回复按钮，否则我收不到提示

chenchen0119 · 发表于 Post on 2022-3-2 15:29:20

sobereva 发表于 2021-12-3 04:20
有什么理由不是氢键？你都知道这是O-H...O典型的氢键结构特征，而且BCP电子密度还那么大，不是氢键是什么 ...

好的，感谢老师

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