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[综合交流] 如何判断加氢和不加氢情况得到的分子轨道是同一个轨道?

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老师,我想问一个问题,就算我想比较两种结构,一种是没有加氢优化出来的一种团簇结构,另一种加上两个氢原子优化得到的团簇结构,我想比较两个分子轨道加氢与未加氢原子的团簇的一个分子轨道是同一个轨道,并没有因为加上氢原子而改变,除了看轨道成分,还可以看其他分析方法吗?

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发表于 Post on 1 hour ago | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “分子轨道分析” 改了,以后务必注意!下次将删帖+扣分处理。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 1 hour ago | 只看该作者 Only view this author
加不加氢不是同一个体系,从这点上就不可能有完全相同的分子轨道
如果从基本特点上判断是否算同一个轨道,肉眼观看轨道等值面图通常就够了。如果需要更进一步细致的说明,可以用Multiwfn做轨道成分分析,看下文
谈谈轨道成份的计算方法
http://sobereva.com/131

也可以用Multiwfn直接对两个计算得到的轨道做对应性分析,可以直接告诉你一个波函数文件里的轨道是如何由另一个波函数文件里的轨道线性组合产生、贡献是多少,看Multiwfn手册3.200.6节的功能介绍和4.200.6节的例子。注意对当前问题用这个功能前需要先把两个体系相同的区域做对齐(align)后再计算轨道波函数,并且计算时如果用Gaussian程序应当加上nosymm关键词免得自动调整到标准朝向
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