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[ORCA] 关于使用orca做磷杂peterson烯化过程AIMD分析的问题

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最近我在研究如下图所示的一个磷杂peterson烯化过程,通过柔性扫描和IGMH分析,我们相信该步骤是一个无TS的过程,并且O与Si之间的弱相互作用力是该反应的关键。

我们决定使用使用ORCA做从头算动力学(AIMD)的简单例子 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元的方法,对该反应进行动力学计算,得到了O与Si的距离和P与C的距离随时间变化的折线图。我了解到,orca会根据系统时间对各个原子初始速度进行初猜,想问一下,通过投多个AIMD 任务,计算不同初猜下该反应键长的变化是否具有科学意义?如果需要,大概多少条反应路径够呢?

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发表于 Post on 2026-3-19 23:55:54 | 只看该作者 Only view this author
那不叫初猜,而是对初速度进行随机初始化

如果你想体现反应过程很快,跑5条轨迹,如果都是这个结论,就足够说明问题
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-3-20 08:17:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-3-19 23:55
那不叫初猜,而是对初速度进行随机初始化

如果你想体现反应过程很快,跑5条轨迹,如果都是这个结论,就 ...

好的好的!感谢老师

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发表于 Post on 2026-3-20 08:54:11 | 只看该作者 Only view this author
这反应式的氢数和电荷数都不守恒啊
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-3-20 10:27:16 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2026-3-20 08:54
这反应式的氢数和电荷数都不守恒啊

只是示意老师,实际反应有强碱拔氢,同样感谢老师回答!

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