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[综合交流] 求助:Amber99sb和GAFF2力场混用是否是最好的解决办法

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楼主
阴离子聚合物溶液的模拟,使用GAFF2+RESP+TIP4P-ICE组合。
问题1:GAFF2使用sobtop可生成阴离子聚合物的top和itp文件,但做空白实验时(只有水或者水和金属离子),是否可以在拓扑文件中引用Amber99sb.ff/forcefield.itp和Amber99sb.ff/ions.itp,因为我主要还是想使用GAFF2力场,不知道这种混用是否是最好的办法,或者有更好的代替AMBER99SB的力场。
问题2:TIP4P-ICE是显式溶剂模型,我在计算RESP电荷时是否应该完全在真空中计算,以保证TIP4P-ICE不带来对阴离子聚合物“双重极化”,过度亲水的问题

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2#
发表于 Post on 2026-3-25 02:43:59 | 只看该作者 Only view this author
1 可以,你引用其它的AMBER力场文件也都一样,因为描述阴离子部分根本不用到里面提供的参数

2 模拟溶液干嘛用专门适合描述冰点附近的TIP4P-ICE?若无特殊情况,用OPC好得多
避免溶剂的极化效应描述过头就用RESP2(0.5)
RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/531http://bbs.keinsci.com/thread-16190-1-1.html
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-3-25 10:32:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-3-25 02:43
1 可以,你引用其它的AMBER力场文件也都一样,因为描述阴离子部分根本不用到里面提供的参数

2 模拟溶液 ...

感谢老师的解答,我使用TIP4P-ICE模型确实是有特殊的情况。我会改用RESP2(0.5)来计算电荷,再次谢谢sob老师

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