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[GROMACS] 求助水合物生长过程模拟晶种却分解是哪里出问题了?

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本人建立如图所示的模型进行二氧化碳水合物在氯化钠溶液中生长过程的模拟,模型结构大致为:
    二氧化碳/氯化钠溶液/二氧化碳水合物晶种(3*3*2)/氯化钠溶液/二氧化碳
选择的水分子模型为tip4p/ice,二氧化碳采用EPM2模型,离子采用Madrid-2019 ,具体设置放在压缩包中。
本意是想模拟二氧化碳水合物的生长过程,但是在NVT(260K)下预平衡1ns后好像看到晶种分解了,多次在不同温度压力下进行模拟都发现了分解的情况。新手第一次做MD模拟,仔细查询了各个文件但是不知道问题究竟出在哪里,不知道是不是力场设置的有问题呢?还请各位老师指教。万分感谢!

202604222345562058..png (95.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

晶种分解

晶种分解

202604222335361814..png (837.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

模拟体系构型

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sysNaCl3.5.zip

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发表于 Post on 4 hour ago | 只看该作者 Only view this author
我没时间具体看你的文件。如果确保参数、拓扑文件等方面合理,先尝试把水合物部分加限制势,看能否生长起来。如果能的话,再放开限制,作为正式的模拟
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