计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 611|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 生物膜跑完NPT,如何查看膜是否预平衡好

[复制链接 Copy URL]

62

帖子

0

威望

167

eV
积分
229

Level 3 能力者

是否需要查看膜的密度,每脂质面积,膜厚度以及RMSD,没问题了再跑100ns生产,下面是VMD查看NPT后的膜

202604251505473065..png (515.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 107)

202604251505473065..png

202604251505429583..png (331.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 90)

202604251505429583..png

202604251505335328..png (328.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 98)

202604251505335328..png

202604251505258029..png (416.83 KB, 下载次数 Times of downloads: 106)

202604251505258029..png

202604251505142206..png (685.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 102)

202604251505142206..png

416

帖子

0

威望

1083

eV
积分
1499

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2026-4-25 17:10:13 | 只看该作者 Only view this author

62

帖子

0

威望

167

eV
积分
229

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-4-25 19:14:12 | 只看该作者 Only view this author
KazusaT 发表于 2026-4-25 17:10
谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡

谢谢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-8-6 13:17 , Processed in 0.215607 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list