[综合讨论] 求助NAMD计算导致能级交叉-平衡结构与动态结构下部分电荷密度分析不一致

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发表于 Post on 5 hour ago | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励

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大家好，

我在使用NAMD方法研究材料的激发态动力学时，遇到了平衡结构与动态结构电荷密度归属的问题。采用2 ps的NVE升温（300 K）分子动力学，接着继续轨迹分子动力学计算，从轨迹中选取某一帧作为代表结构。（如果整条轨迹普遍出现这种情况）我想在想问一下，现在后处理设置占据态，请问是要按照初态的态设置还是按照现在轨迹自洽情况设置？还是说是计算的问题，需要重新验证？

谢谢

本主题由 sobereva 于 3 hour ago 分类

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