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[综合讨论] 求助NAMD计算导致能级交叉-平衡结构与动态结构下部分电荷密度分析不一致

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楼主
大家好,
我在使用NAMD方法研究材料的激发态动力学时,遇到了平衡结构与动态结构电荷密度归属的问题。采用2 ps的NVE升温(300 K)分子动力学,接着继续轨迹分子动力学计算,从轨迹中选取某一帧作为代表结构。(如果整条轨迹普遍出现这种情况)我想在想问一下,现在后处理设置占据态,请问是要按照初态的态设置还是按照现在轨迹自洽情况设置?还是说是计算的问题,需要重新验证?
谢谢

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