oniom计算S1激发态发射光谱求助

iamjjLin

各位老师，大家好！

我想计算薄膜中某个分子的S1激发态发射光谱，受到这篇帖子的启发（oniom计算激发态及背景电荷求助 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社），设计了以下的计算流程：
1、用packmol将单个发光分子和大量主体分子放进晶胞，使用GROMACS跑一段动力学达到平衡，以发光分子为中心抠出团簇。
2、对团簇使用oniom方法，优化中心分子的S1态结构。
3、使用oniom优化后的团簇，将周围分子都用拟合静电势电荷当成背景电荷，计算中心分子的S1态发射光谱。

请问各位老师，这个流程合理吗？有没有需要改进或注意的地方。谢谢！

cokie

看你的描述，薄膜是非单一成分的，是所谓“主体分子”+“发光分子”的混合物旋涂。那么你需要考虑：
1. 如果发光分子和主体分子是按某摩尔比混合的，packmol构建体系时也需要按此摩尔比；
2. 如果发光分子是痕量参杂，那建议你可以考虑直接把客体分子，替换主体分子晶体中的其中一个分子，抠出团簇冻结边缘跑xtb即可，无需MD。
3. 采用方法2的前提，是纯主体分子的XRD与主体+客体参杂后的XRD无明显的区别（即晶相和晶胞参数不受影响）才可以。
4. 主客体体系通常存在分子间电子转移，你的步骤2、3会忽略掉电子转移发光的情况，如果你的实测光谱中有明显的、相比单客体发光多出的CT组分，建议补充一个客体+主体的二聚体参比并计算发光。