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[GROMACS] 做短肽在水溶液中的自组装模拟,如何确定模拟过程中关键参数设置

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发表于 Post on yesterday 23:30 | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
老师，我现在在做一段短肽在水溶液中的自组装模拟，用的是 GROMACS+Amber19SB 力场搭配 OPC 水模型。目前已经生成了topol.top，想请教能量最小化、NVT/NPT 平衡和生产 MD 的关键参数设置要点，尤其是适配自组装体系的特殊设置～
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 楼主 Author| 发表于 Post on yesterday 23:31 | 只看该作者 Only view this author
我打算做500ns模拟
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