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[新手求助] 使用Gaussian进行结构优化但分子中二茂铁结构总是明显畸变的问题请教

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本帖最后由 gmuCJH 于 2026-4-30 23:40 编辑

各位坛友大家好,我现在用Gaussian做一个含二茂铁结构的反应物分子的结构优化,我用gview进行分子结构建模,起始结构中二茂铁为夹心结构,但是计算结束后(normal结尾),二茂铁的夹心结构畸变很明显,并且得到的结构显示Fe还与五元环上的部分碳原子形成了共价键。我尝试在gview中将二茂铁的10个碳原子和1个Fe原子结构固定(不参与优化),优化的结构二茂铁部分是夹心结构,但是我觉得这种处理不符合计算的实际情况,但是,只要整个分子一起优化,二茂铁的结构就会变的很乱(如图所示,选中的原子为二茂铁的碳原子)。所以,在此请教一下大家,怎么在用gaussian进行结构优化的过程中保持二茂铁结构部分的合理性,谢谢!

说明:(1)提到的二茂铁畸变的输入文件2个gjf和计算输出文件2个log,均在附件压缩包Files文件夹中,即固定和没固定二茂铁的相关计算文件;(2)我用的DFT水平很烂,因为我只是想先看一下大概结构,然后再用高水平的进行计算。

优化后的结构.png (72.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

优化后的结构

优化后的结构

起始结构.png (68.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

起始结构

起始结构

Files.rar

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计算的输入和输出文件

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