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[GROMACS] 如何制作OPC的gro文件

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发表于 Post on 2026-5-5 14:12:55 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
我的蛋白想添加opc溶剂,但是am19sb中没有opc.gro,只有opc.itp,请问如何制作opc.gro文件

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Level 6 (一方通行)

发表于 Post on 2026-5-5 15:06:56 | 显示全部楼层 Show all
理解一下这句话,三点水,或者四点水,只要赋予它opc3的参数,那么就是使用了opc3水模型,赋予opc4的参数,那么就是使用opc4水模型。

又菜又爱玩

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发表于 Post on 2026-5-5 18:21:28 | 显示全部楼层 Show all
gro 四点水用tip4p.gro,三点水用spc216
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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