“第25届北京科音初级量子化学培训班” 将于6月11至14日于北京举办,是初学者真正从头一次性完整、系统性学习量子化学计算,从而能很快上手量子化学研究的重要机会,比起自己摸索、鼓捣能少走无数弯路。报名正在进行中,请点击此链接查看,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 380|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 如何制作OPC的gro文件

[复制链接 Copy URL]

60

帖子

0

威望

157

eV
积分
217

Level 3 能力者

我的蛋白想添加opc溶剂,但是am19sb中没有opc.gro,只有opc.itp,请问如何制作opc.gro文件

1620

帖子

0

威望

5266

eV
积分
6886

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2026-5-5 15:06:56 | 只看该作者 Only view this author
理解一下这句话,三点水,或者四点水,只要赋予它opc3的参数,那么就是使用了opc3水模型,赋予opc4的参数,那么就是使用opc4水模型。

又菜又爱玩

1061

帖子

4

威望

2594

eV
积分
3735

Level 5 (御坂)

A Student

3#
发表于 Post on 2026-5-5 18:21:28 | 只看该作者 Only view this author
gro 四点水用tip4p.gro,三点水用spc216
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-6-10 16:27 , Processed in 0.237059 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list