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[Gaussian/gview] 求助高斯寻找质子转移过渡态几何优化不收敛该怎么解决

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本帖最后由 mtdykx 于 2026-5-17 20:58 编辑

在寻找质子转移过渡态时,遇到了几何优化不收敛的问题。使用限制性优化固定两个键长虚频可以达到-1803,放开后就Maximum Force不收敛,或者只有一个甲基转动的小虚频
基于社长的帖子尝试了许多方法:
# opt=(calcfc,ts,noeigen,maxstep=1,notrust) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm(Maximum Force不收敛)
# opt=(calcfc,ts,noeigentest,GDIIS) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm (只有一个甲基转动的小虚频)
# opt=(calcfc,ts,noeigentest,RFO) freq wb97xd/6-31g(d,p) nosymm scrf=(cpcm,solvent=water)(没有虚频)
# opt=(calcfc,ts,noeigentest,Cartesian) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm Maximum Force, RMS Force两个NO
# opt=(calcfc,ts,noeigentest,maxstep=1,notrust) freq B3LYP/6-31g(d,p) nosymm scrf=(cpcm,solvent=water)(Maximum Force不收敛)
# opt=(calcfc,ts,noeigentest,GDIIS,maxstep=1,notrust) freq wb97xd/6-31g(d,p) nosymm scrf=(cpcm,solvent=water) (4个NO)
# opt=(calcfc,ts,noeigentest,recalc=1) freq wb97xd/6-31g(d,p) nosymm scrf=(cpcm,solvent=water)(没有虚频)
# opt=(calcfc,ts,noeigentest,GEDIIS) freq wb97xd/6-31g(d,p) nosymm scrf=(cpcm,solvent=water) (只有一个甲基转动的小虚频)
然后还做了刚性扫描,把有可能的坐标都计算了TS还是没有找到,不知道哪里出了问题,因此来发第一次贴求助,恳求老师的帮忙。



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鸩羽

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发表于 Post on 2026-5-6 13:18:15 | 只看该作者 Only view this author
用ORCA的NEB试试
某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

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发表于 Post on 2026-5-6 17:34:15 | 只看该作者 Only view this author
根据我以往的经验,经验之谈,不保证有效(叠甲)
我看了你的文件,问题可能出在47-77-76这三个原子的距离过近上。
我建议,你可以先冻结甲基苯那一块,然后将47-77-76这两个键拉长,做过渡态优化。如果能拿到正确虚频的结果,再解除冻结,在现有结构上将距离扩大0.05~0.1A放进去优化。

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4#
发表于 Post on 2026-5-6 19:49:25 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 J.Liu 于 2026-5-6 19:50 编辑

适当的拉伸距离试一下,给足一定的优化空间。
机子能负担的情况下最好每一步都精确计算一下Hessian。
求真务实!脚踏实地!

量子力学的忠实爱好者,爱屋及乌,以至于后来做了量子化学计算!
喜研究算法,对FORTRAN语言抱有偏爱!
偶尔研究分子动力学模拟,第一性原理计算也稍有涉猎(起初是大体系量化算不动的无奈之举,后产生了一丝丝感情)

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发表于 Post on 2026-5-7 13:36:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 sai77 于 2026-5-7 13:38 编辑

分别试了recalc=1和maxstep=1,为啥这俩不一起试试?不用设成1这么小,3-5就行。
另外最好读取限制性优化好的波函数

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Level 5 (御坂)

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发表于 Post on 2026-5-7 15:59:54 | 只看该作者 Only view this author
经验上断/成键的键长在TS会是成键时候的1.5倍。或许可以让你TS里的O-H键再长些。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-5-9 18:31:26 | 只看该作者 Only view this author
iamjjLin 发表于 2026-5-6 17:34
根据我以往的经验,经验之谈,不保证有效(叠甲)
我看了你的文件,问题可能出在47-77-76这三个原子的距离 ...

之前键长是1.37和1.37,尝试了把键长拉长到1.42和1.42
# opt=(calcfc,ts,modredundant,noeigen,maxstep=1,notrust) freq
wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity固定甲苯上甲基二面角去找TS,  Maximum Force, Maximum Displacement,RMS     Displacement 三个是NO
# opt=(calcall,ts,modredundant,noeigen,maxstep=1,notrust) freq
wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity固定甲苯上甲基二面角去找TS,两天没算完中断了
把键长拉长到1.47和1.47,
# opt=(calcall,modredundant,ts,noeigen,GDIIS,maxstep=1,notrust) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity   固定甲苯上甲基二面角去找TS,两天没算完中断了
# opt=(calcall,modredundant,ts,noeigen,recalc=1) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity 固定甲苯上甲基二面角去找TS,只有一个甲苯转动的小虚频
# opt=(calcall,modredundant,ts,noeigen,GEDIIS) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity
固定甲苯上甲基二面角去找TS,当前搜索点的 Hessian 矩阵没有负本征值报错
# opt=(calcfc,modredundant,ts,noeigen,recalc=3) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity固定甲苯上甲基二面角去找TS,只有另一个甲基转动的虚频  
# opt=(calcfc,ts,modredundant,noeigen,recalc=3,maxstep=1) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity 把另一个甲基转动也固定上,两天没算完中断
# opt=(calcfc,modredundant,ts,noeigen,GDIIS) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity 固定甲苯上甲基二面角去找TS,只有另一个甲基转动的虚频  
# opt=(calcfc,modredundant,ts,noeigen,GDIIS) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity 把另一个甲基转动也固定上,没有虚频  
# opt=(calcfc,modredundant,ts,noeigen,RFO) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity
固定甲苯上甲基二面角去找TS,只有另一个甲基转动的虚频 ,把另一个甲基转动也固定上,又出现另一个甲基转动的虚频
# opt=(calcfc,modredundant,ts,noeigen,maxstep=1,loose) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity 固定甲苯上甲基二面角去找TS,Maximum Force不收敛
# opt=(calcall,modredundant,ts,noeigen,maxstep=1,notrust) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity 固定甲苯上甲基二面角去找TS,两天没算完
# opt=(calcfc,modredundant,ts,noeigen,maxstep=1,notrust) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity Maximum Force不收敛

全放开找TS
# opt=(calcfc,ts,noeigen,maxstep=1,notrust) freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm geom=connectivity
键长拉长到1.47和1.47:Maximum Force不收敛
键长拉长到1.52和1.52 Maximum Force不收敛
把键长拉长到1.52和1.47:Maximum Force不收敛

固定键长1.52和1.47时虚频最大,又试了
%chk=scan_1.52_1.47.chk
# opt=(rcfc,ts,noeigen,maxstep=1,notrust) guess=read freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm:Maximum Force不收敛

%chk=scan_1.52_1.47.chk
# opt=(rcfc,ts,noeigen,maxstep=1,notrust,recalc=3) guess=read freq wb97xd/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm两天没算完中断了

# opt=(calcfc,ts,noeigen,maxstep=1,notrust) guess=read freq b3lyp/6-31g(d,p) scrf=(cpcm,solvent=water) nosymm :Maximum Force不收敛,
最后还是没有找到TS,不知道问题出在哪里了,请问还有没有别的方法可以尝试@J.Liu @sai77 @Stardust0831

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发表于 Post on 2026-5-10 11:14:37 | 只看该作者 Only view this author
可能是个没有能垒的反应,使用UMA medium 1.1 MLIP试了下简化的甲醇阴离子和苯酚,优化开始前MeO----H距离为3A,maxstep=5,notrsut,仅进行opt,优化过程中能量平滑下降,得到的最终结构为甲醇和苯酚阴离子

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-5-10 21:57:10 | 只看该作者 Only view this author
Rowena 发表于 2026-5-10 11:14
可能是个没有能垒的反应,使用UMA medium 1.1 MLIP试了下简化的甲醇阴离子和苯酚,优化开始前MeO----H距离 ...

感觉可能是能垒极低的过程,但也会有处于势能面一阶鞍点的结构吧

本版积分规则 Credits rule

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