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[CP2K] cp2k结构优化求助

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Level 1 能力者

我的硅纳米片是半羟基取代的,现在要负载上金属,比如金。我先尝试了一个金负载在硅纳米片上,然后用cp2k进行结构优化,我的inp文件如下所示


&GLOBAL
  PROJECT SiOH_Au                        ! 项目名称
  RUN_TYPE GEO_OPT                       ! 计算类型:结构优化
  PRINT_LEVEL MEDIUM                     ! 打印信息详细程度
&END GLOBAL


&FORCE_EVAL
  METHOD Quickstep
  &DFT
    POTENTIAL_FILE_NAME  GTH_POTENTIALS  
    BASIS_SET_FILE_NAME  BASIS_MOLOPT  
#    LSD .TRUE.  
    &MGRID
      CUTOFF   600                       ! 平面波截断能 (Ry)
      REL_CUTOFF 65                      ! 相对截断能 (Ry)
    &END MGRID
    &SCF
      SCF_GUESS ATOMIC
                  
      EPS_SCF  1.0E-6                    ! SCF收敛标准
      MAX_SCF  40                       ! 最大SCF迭代次数
#      &SMEAR
#        METHOD FERMI_DIRAC                  
#        ELECTRONIC_TEMPERATURE 0.001        !单位是Hartree,约300K
#      &END SMEAR
      &OT
        ALGORITHM IRAC
        PRECONDITIONER FULL_SINGLE_INVERSE
        MINIMIZER CG
      &END OT
      &OUTER_SCF .TRUE.               ! 添加 OUTER_SCF 块,激活外层循环
           EPS_SCF 1.0E-6         ! 外层循环收敛标准,应与内层相同或更严格
           MAX_SCF 10             ! 外层循环最大迭代次数
           OPTIMIZER DIIS         ! 推荐 DIIS 优化器
      &END OUTER_SCF
    &END SCF
    &XC
      &XC_FUNCTIONAL PBE                 ! 交换关联泛函
      &END XC_FUNCTIONAL
      &VDW_POTENTIAL
        POTENTIAL_TYPE PAIR_POTENTIAL
        &PAIR_POTENTIAL
          TYPE DFTD3                     ! Grimme D3 色散修正
          REFERENCE_FUNCTIONAL  PBE
          PARAMETER_FILE_NAME  dftd3.dat
          CALCULATE_C9_TERM  .FALSE.
        &END PAIR_POTENTIAL
      &END VDW_POTENTIAL
    &END XC
  &END DFT


  &SUBSYS
    &CELL
      A  29.028  0.0  0.0
      B  0.0  25.140  0.0
      C  0.0  0.0  26.307
      PERIODIC XYZ
    &END CELL
     &TOPOLOGY
     COORD_FILE_FORMAT CIF
     COORD_FILE_NAME si+Au_yuan.cif
     &END TOPOLOGY            
    &KIND Si
      BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
      POTENTIAL GTH-PBE-q4
    &END KIND
    &KIND O
      BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
      POTENTIAL GTH-PBE-q6
    &END KIND
    &KIND H
      BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
      POTENTIAL GTH-PBE-q1
    &END KIND
    &KIND Au
      BASIS_SET DZVP-MOLOPT-SR-GTH
      POTENTIAL GTH-PBE-q11
    &END KIND
  &END SUBSYS
  &PRINT
    &FORCES ON
    &END FORCES
  &END PRINT
&END FORCE_EVAL


&MOTION
#  &CONSTRAINT
#    &FIXED_ATOMS
#      COMPONENTS_TO_FIX XYZ
#      LIST 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64              ! 固定所有Si原子的序号
#    &END FIXED_ATOMS
#  &END CONSTRAINT
  &GEO_OPT
    TYPE MINIMIZATION                    ! 优化类型
    MAX_ITER 300                         ! 最大优化步数
    MAX_DR 3.0E-4                        ! 最大位移收敛标准 (bohr)
    OPTIMIZER BFGS
  &END GEO_OPT  
  &PRINT
    &TRAJECTORY
      &EACH
        GEO_OPT 1
      &END EACH
      FILENAME =optimized.xyz
    &END TRAJECTORY
  &END PRINT
&END MOTION
然后优化好之后得到了restart文件和hessian文件,我下一步是不是应该提取成键参数?然后同步进行振动分析?求老师解答之后的流程该是什么样的

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2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 3 hour ago | 只看该作者 Only view this author
我的老师让我先做一组出来看看,走一下整个流程,我的后续是想看金负载硅纳米片上之后对过氧化氢的吸附分布的影响?做DFT计算和PDOS

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