求助结合能计算过程溶剂模型的考虑

downpuor · 发表于 Post on 2026-5-18 19:53:13

各位老师好，我看目前进行结构优化和结合能计算中考虑溶质处于凝聚相的情况都是采用隐式溶剂模型，如果是像萃取这样处于两相而非单一连续介质的环境，同时我的溶质在两相中的形态发生了变化，也就是Li+在A水相中是Li+-4H2O，然后转移到B相，在有机相B相中是Li+-TBP-Cl，1.考虑隐式溶剂模型是否就不够合理？2.我该怎么在量化计算添加显示溶剂模型呢，是否考虑分子动力学模拟更合理一些。

sobereva · 发表于 Post on 2026-5-18 23:06:29

单原子离子用隐式溶剂模型没法准确描述，下文明确说了
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327（http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html）

这么简单的体系，genmer结合molclus做构型搜索就可以产生溶剂化Li+离子结构，参考下文。当然你不嫌麻烦的话跑动力学代替genmer产生初始结构也完全可以
genmer：生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html

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[综合交流] 求助结合能计算过程溶剂模型的考虑