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[综合交流] 将QM计算Hirsheld电荷换作MM电荷后计算的结果有差异

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各位老师好,我最近在做一个蛋白质计算的测试,产生了一些疑问,想请教一下老师:
在进行QM/MM的计算中,首先,我把研究对象A和影响的B残基Pro都算进了QM,而其他部分用点电荷嵌入的MM表示。在计算激发态后,我使用Hirsheld电荷产生了对应的电荷并重新进行QM/MM计算,其中再次计算时,QM仅包含研究对象A,而B残基作为MM点电荷嵌入,该电荷修改为上述计算的Hirsheld电荷,再重新计算激发态。我发现先前A+B计算激发态的值为470nm,而修改后则为432nm;然而,当我使用B残基的AMBER电荷做点电荷嵌入时是435nm。我怀疑在此过程中,量子效应可能较大。但我同时对操作是否有问题产生了疑问,为什么Hirsheld激发态电荷的拟合后为什么数值并不会更靠近A+B的值,以及是否可以通过修改电荷更加接近A+B同作QM时的值。
其中研究对象A和B存在一定的平行性,类似π作用,且B与A有氢键连接(以Pro的C=O与对象A的N-H作用),在将B考虑为QM时会加帽。且A与B几乎不发生CT(经过IFCT验证)。
Hirsheld的电荷计算基于Multiwfn的7→11( Atomic dipole corrected Hirshfeld atomic charge (ADCH))
且gaussian计算激发态的表头为# wb97xd/gen td=(root=1, nstates=5) IOp(9/40=3) charge Nosymm  (gen为对阴离子加弥散)

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2#
发表于 Post on halfhour ago | 只看该作者 Only view this author
Hirshfeld对分子表面静电势描述极差,用于做电子嵌入目的的原子电荷完全离谱
看下文了解原子电荷的基本常识和不同计算方法的特点。只有对分子表面静电势重现性较好的原子电荷才能用于这种目的
一篇深入浅出、完整全面介绍原子电荷的综述文章已发表!
http://sobereva.com/714http://bbs.keinsci.com/thread-46067-1-1.html
《原子电荷计算方法的对比》(https://doi.org/10.3866/PKU.WHXB2012281
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html

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