关于模拟阴阳离子的电荷缩放设置

downpuor

各位老师我想使用文献中的金属和OH-的力场参数，查阅到文献的金属电荷为了弥补力场极化效应进行了0.85倍的缩放，同时文献对应的阴离子包括一系列卤素原子和OH-为了电中和也采用了0.85倍的缩放。我的体系中对应的阴离子是去羟基去质子化的-2价的9,9-二（3-氨基-4-羟苯基）芴阴离子，是一个是大共轭体系，其中掉下来的质子H和OH-中和，我要采用文献的力场参数的话是否应该将Na+和OH-的电荷还原为+1 和 -1价态比较合适？还是将部分和-2价的9,9-二（3-氨基-4-羟苯基）芴阴离子进行中和的Na+还原为+1电荷即可？我想知道考虑电荷缩放和放大除了考虑溶剂极化效应还有什么需要考虑的嘛？

sobereva

8成你说的是madrid 2019力场。你要用这个就必须用原文里的电荷，不能自己随便改。如果实际不合适（比如算上你自己体系中非madrid-2019直接支持的离子后体系净电荷不为0），就别用那个力场。
OH-的拓扑文件用sobtop（http://sobereva.com/soft/Sobtop）可以直接创建