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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › gromacs动力学结果可视化异常
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[VMD] gromacs动力学结果可视化异常

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微塑料

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发表于 Post on 3 hour ago | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
首先这是出现问题的可视化结果： 。可以看到有几条线段出现在盒子里面。这是什么原因呢？
体系中的分子是聚乳酸和柠檬酸三丁酯，分别加入了Na离子和Cl离子。

vmd的参数：设置了三个Rep：Qicksurf 。
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