区分液液两相界面体系中两相和界面区域的疑问

downpuor · 发表于 Post on 2026-6-10 00:07:51

各位老师我想考察同一分子在液液两相处和界面处的不同扩散以及和溶剂作用情况等，想知道对于液液两相模拟的体系，例如油-水两相体系，是怎么区分纯油相，纯水相和界面区域的，并且计算得到界面厚度。以“90-90”标准计算界面厚度为例子，即从纯油相90%的位置到纯水相90%的位置之间的距离作为界面区域。其中通过gmx density得到水油两相的密度图，类似于图1，其中z轴-4到-3nm的平台和3到4nm的平台是不是就是看作纯水相和纯油相，并且轴坐标对应的就是纯水相和纯油相的密度，并在此基础上进行计算得到的界面区域？而简单的把所有水分子和所有有机分子看作纯水相和纯油相，同时选择所有水分子取平均密度，以及取所有有机分子取平均密度作为水相和油相的密度是不合理的对吗？

KazusaT · 发表于 Post on 2026-6-10 05:28:32

没读懂“简单的把所有水分子和所有有机分子看作纯水相和纯油相，同时选择所有水分子取平均密度，以及取所有有机分子取平均密度作为水相和油相的密度”是什么意思
gmx density是取数个z轴切片来得到密度沿z方向的分布，很明显油相和水相有两个平台，取平台的均值作为密度就好

downpuor · 发表于 Post on 2026-6-10 14:31:41

KazusaT 发表于 2026-6-10 05:28
没读懂“简单的把所有水分子和所有有机分子看作纯水相和纯油相，同时选择所有水分子取平均密度，以及取所有 ...

就是说把水分子看作一个组，然后提取随时间变化(例如10ns)的水分子的密度取平均值。

downpuor · 发表于 Post on 2026-6-10 14:33:18

本帖最后由 downpuor 于 2026-6-10 15:04 编辑

KazusaT 发表于 2026-6-10 05:28
没读懂“简单的把所有水分子和所有有机分子看作纯水相和纯油相，同时选择所有水分子取平均密度，以及取所有 ...

老师如果平台不是很均匀，出现一侧陡峭也取平均吗？类似于下图这样的情况，该怎么选择平台范围比较合适呢

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[综合交流] 区分液液两相界面体系中两相和界面区域的疑问