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[GROMACS] 聚合物溶液体系模拟求助

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本帖最后由 lts! 于 2026-6-12 16:11 编辑

我模拟的体系主要包括了20条共聚物的聚合物链,20000个邻二甲苯分子,首先做了NPT退火处理,从300K到550K再到300K,重复三次,在退火结束后,聚合物链的结构较为紧凑,比较符合我的预期,但是继续300K平衡后,聚合物链逐渐舒展开来,这种聚合物在常温应当是预聚集较强的,请问是否可以通过调整力场参数进行调整,目前的力场参数用的是GAFF2预建参数,如果采用Hessian矩阵得到的键角参数是否会促进聚合物的聚集呢?

刚退火结束时的盒子形态

刚退火结束时聚合物的分布形态

基本平衡后加上溶剂分子后的总体分布

基本平衡后聚合物链的分布





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2#
发表于 Post on yesterday 10:41 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 dayu8278 于 2026-6-13 11:01 编辑

主要是看你的高分子结构,是否有氢键等作用导致其能够发生塌缩?

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