CP2K的GPU加速版本编辑问题以及如何并联两台主机

madhatter · 发表于 Post on 前天 17:15

小青椒一枚  从学科建设实验室的垃圾堆里找到了两台吃灰的小服务器(原本是五台  我抢到了两台还是挺开心的哈哈哈)
机器情况
配置是i9-11900K 3.5GHZ 8核
内存64G
显卡4070Ti
这个配置的主机目前有两台  因为原本有学科软件所以原有的win10系统没办法换掉
主用软件情况
CP2K为主  ORCA其次  少量用QE  刚参加了论坛的分子动力学培训所以GROMACS后续也会主用  我主要做材料第一性或者aimd的模拟  小体系量化电解液/电池材料等方向
目前有几个问题要考虑(先以一台主机考虑)：
1.有还不错的显卡就想利用上，GROMACS很香，但是我主用的CP2K，它的GPU加速版本速度如何，因为CPU基本就这些，考虑编辑GPU版本，想问一下大家意见是否合适。(我看到有人推荐VSAP加速版)
2.因为原有的系统不能变，考虑wsl2还是做双系统，我看论坛有人说wsl2的效率很高，所以也想听听大家建议。
3.目前有两个主机，如何能把两个机器联合到一起使用，例如我直接跑16核的CP2K，或者用两张卡跑GROMACS，最好是可以做成节点那种，可以直接用远程提交任务(是否有这个必要，也想让大家给个意见)
4.目前手里有点经费，在考虑要不要买个好的CPU加装上，这个可以靠后讨论。
贫穷青椒  能白嫖到两个小机器已经很开心了  大佬们请大佬们合理加配置

Stardust0831 · 发表于 Post on yesterday 09:15

VASP的gpu加速效果很不错的原因是pw本身就比较适合这种并行，pw本身计算量也贼大，可能gpu加速了好几倍的vasp还没纯CPU的cp2k快hhh。我觉得跑CP2K可以看看买二手的双路EPYC米兰，CP2K的CPU并行本身超级强。我做过基于V100显卡的加速，有些考验个人用法和调优能力，我只榨出了约40%的油水/速度提升。

wsl2因为是windows原生的子系统，所以虚拟化开销可以比普通虚拟机更小、和windows文件互通更好、gpu加速支持也不错。但由于定位是子系统，所以不是一个完整、独立的linux环境。我习惯是ORCA优先试试看直接windows版，剩下的俩可以wsl，主要考虑到orca对文件读写的性能要求贼大、或许可以避免一下文件系统虚拟化的开销。

没必要联合，现在资源量太少了，要组的话还得买InfiniBand交换机啥的，投入产出比有限。

PLwang · 发表于 Post on yesterday 11:51

可以考虑买个CPU。这个GPU做一些MD，还是很不错的，但做VASP可能效果一般般。而且如果你们CP2K用的很熟练的话，CPU就可以，没必要考虑GPU加速的CP2K

madhatter · 发表于 Post on yesterday 12:19

PLwang 发表于 2026-6-13 11:51
可以考虑买个CPU。这个GPU做一些MD，还是很不错的，但做VASP可能效果一般般。而且如果你们CP2K用的很熟练的 ...

我想问下大佬，如果换个cpu 他原本的软件内容会受影响吗？因为里面有一个学科软件，当初花了十多万买的，目前只要我不动这个软件，随便我弄，如果换的话这种应该是单路我推荐吗？我看sob老师推荐的单路cpu都得一万多

madhatter · 发表于 Post on yesterday 12:22

Stardust0831 发表于 2026-6-13 09:15
VASP的gpu加速效果很不错的原因是pw本身就比较适合这种并行，pw本身计算量也贼大，可能gpu加速了好几倍的va ...

我以前也是这样用的，orca用win版本，cp2k和gmx上的虚拟机，那我先编译吧，cp2k的gpu版本当纯cpu用速度有变化吗？如果没有那我直接编译gpu版本就行了是吧

Stardust0831 · 发表于 Post on yesterday 13:57

本帖最后由 Stardust0831 于 2026-6-13 14:05 编辑

madhatter 发表于 2026-6-13 12:19
我想问下大佬，如果换个cpu 他原本的软件内容会受影响吗？因为里面有一个学科软件，当初花了十多万买的， ...

买EPYC肯定是新配的服务器，会比消费级明显更稳定。
卢老师推荐的9950X也依然是消费级的东西，单核很强，但是CP2K并行极好、更应该关心吞吐量。
EPYC还有明显更多的内存通道，内存吞吐和内存总量都比9950X更富裕、这俩也都是VASP和CP2K亟需的。

我来给方案的话EPYC的7B13最近性价比很好，如果报销比较灵活的话内存可以用升频到3200的ddr4 32G ecc，一定要3200原因是内存带宽很重要、是瓶颈。
游戏卡本身跑dft计算性价比差，如果是v100这种专业显卡，对VASP、abacus这种第一性原理程序的gpu加速极强、配好多卡多节点并行以后能跑大几千原子的VASP都不吃力。卡本身也比较旧，性价比明显更好。

madhatter · 发表于 Post on yesterday 15:19

Stardust0831 发表于 2026-6-13 13:57
买EPYC肯定是新配的服务器，会比消费级明显更稳定。
卢老师推荐的9950X也依然是消费级的东西，单核很强 ...

明白了目前先搭建gmx吧先让学生学md吧

UW_0728. · 发表于 Post on yesterday 16:26

1. CP2K的GPU加速不适合单精度显卡（即使双精度卡目前性能也不是很好，只能说正在优化），因此4070Ti就别想了
2. 个人认为双系统更好一些；WSL2不同于一代WSL，没记错的话是通过虚拟机引擎驱动的，因此远比一代WSL更接近原生Linux环境
3. 如果两个主机CPU型号、架构、兼容指令集有区别，那么联用不划算

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