请问老师，13个aa带3个正电荷的肽做自组装，15个肽组成了一个聚集体合理吗

2329568177 · 发表于 Post on 3 hour ago

请问各位老师，我在10nm盒子里随机放入了15条肽，平衡电荷并加入了15Mnacl,做肽自组装，组装成了一个大的聚集体，而不是均匀的小团簇，请问这个合理吗？是否可以用于肽-膜的MD模拟。以及下一步肽放到膜上方1.5nm是否合理?

student0618 · 发表于 Post on 2 hour ago

目的是什么？不说目的无法判断一个模拟流程是否合适。

2329568177 · 发表于 Post on 2 hour ago

student0618 发表于 2026-6-19 11:54
目的是什么？不说目的无法判断一个模拟流程是否合适。

研究肽与膜的相互作用

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[GROMACS] 请问老师，13个aa带3个正电荷的肽做自组装，15个肽组成了一个聚集体合理吗