ORCA作频率计算时在PROPINTZ处崩溃终止

9527253

各位老师好：
我在使用ORCA6.1.0对PA66的三聚体做频率计算时总是会出现以下报错信息：
BATCH   0: Atoms    0 -   30 ( 93 perturbations)
   => H(core) and overlap derivative integrals     ... done (     2.8 sec)
   => Making and storing internal U-coefficients   ... done (     1.7 sec)
   => RI-J derivative integrals                    ... done (    43.7 sec)
   => RI-J response operators                      ... [localhost:06893] *** Process received signal ***
[localhost:06893] Signal: Segmentation fault (11)
[localhost:06893] Signal code: Address not mapped (1)
[localhost:06893] Failing at address: 0x5613e58e6000
[localhost:06893] [ 0] /lib64/libc.so.6(+0x3fc60)[0x7f63b223fc60]
[localhost:06893] [ 1] /lib64/libc.so.6(+0x191f8e)[0x7f63b2391f8e]
[localhost:06893] [ 2] /home/pc/orca/bin/../lib/liborca_tools_mpi-87695a6.so.6(_Z24SHARK_MakeHermiteDensityR11TSharkBasisR10TMatrixSymIiER10BaseTensorILi2ES4_ILi1E14TShellPairDataEEllPS1_IdElRS4_ILi2ES4_ILi1E17TIntermediateDataEE+0x38a)[0x7f63c2de137a]
[localhost:06893] [ 3] /home/pc/orca/bin/../lib/liborca_tools_mpi-87695a6.so.6(_ZN15TSharkInterface18Calc_RI_AuxDensityEP11TSharkBasisP10TMatrixSymIdEl13SHARK_AuxTypeR7TMatrixIdEPS7_b+0x4e7)[0x7f63c2e800d7]
[localhost:06893] [ 4] /home/pc/orca/bin/../lib/liborca_tools_mpi-87695a6.so.6(_ZN15TSharkInterface14Calc_Split_RIJEP11TSharkBasisP10TMatrixSymIdElS4_13SHARK_AuxTypeP7TMatrixIdEP7TVectorIdES8_+0xa99)[0x7f63c2f870c9]
[localhost:06893] [ 5] /home/pc/orca/bin/../lib/liborca_tools_mpi-87695a6.so.6(_ZN15TSharkInterface14Calc_Split_RIJEP10TMatrixSymIdElS2_13SHARK_AuxTypeP7TMatrixIdEP7TVectorIdES6_+0x2f)[0x7f63c2f8661f]
[localhost:06893] [ 6] /home/pc/orca/bin/../lib/liborca_tools_mpi-87695a6.so.6(_Z25SHARK_DRIVER_GeomPert_RHSR13TORCAPointersR15TSharkInterfaceP10TMatrixSymIdER16TMatrixContainerl+0x1d55)[0x7f63bc737ec5]
[localhost:06893] [ 7] /home/pc/orca/bin/orca_propint_mpi(+0x9ebe)[0x561273f90ebe]
[localhost:06893] [ 8] /home/pc/orca/bin/orca_propint_mpi(+0x95e4)[0x561273f905e4]
[localhost:06893] [ 9] /lib64/libc.so.6(+0x2a610)[0x7f63b222a610]
[localhost:06893] [10] /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0x80)[0x7f63b222a6c0]
[localhost:06893] [11] /home/pc/orca/bin/orca_propint_mpi(+0x520b)[0x561273f8c20b]
[localhost:06893] *** End of error message ***
--------------------------------------------------------------------------
Primary job  terminated normally, but 1 process returned
a non-zero exit code. Per user-direction, the job has been aborted.
--------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 0 with PID 0 on node localhost exited on signal 11 (Segmentation fault).
--------------------------------------------------------------------------

ORCA finished by error termination in PROPINT
Calling Command: mpirun -np 4  /home/pc/orca/bin/orca_propint_mpi 3pa66opt.propintinp.tmp 3pa66opt 3pa66opt
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 394]:
  .... aborting the run

[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 394]:
  .... aborting the run
但我在第一次使用时相同的输入文件可以完成计算，但在后续计算BDE时就会出现这种崩溃信息，尝试了一些方法（安装其它版本orca，openmpi）也没有效果
3pa66opt (2).out (64.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

2026-6-27 17:47 上传 Uploaded

点击下载
Click to download
输出文件

3pa66opt.inp (5.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)

2026-6-27 17:47 上传 Uploaded

点击下载
Click to download
输入文件

wzkchem5

“第一次使用时”和后续跑的输入文件、提交到的节点等等都完全一致吗？

9527253

wzkchem5 发表于 2026-6-29 17:03
“第一次使用时”和后续跑的输入文件、提交到的节点等等都完全一致吗？

老师，我用的是实验室自己组装的机器，就是到后面频率计算出问题，会改%maxcore   %pal nprocs，别的应该都是一致的

wzkchem5

9527253 发表于 2026-6-29 18:57
老师，我用的是实验室自己组装的机器，就是到后面频率计算出问题，会改%maxcore   %pal nprocs，别的应该 ...

估计还是内存相关问题，在确定nprocs*maxcore小于物理内存（不包括虚拟内存）的80%的情况下，减小nprocs、增加maxcore再试

HamsterXiao

频率计算有较大的内存和硬盘需求，之前我出现过类似报错是临时文件把硬盘占满了，可以检查一下硬盘有没有足够空间

9527253

wzkchem5 发表于 2026-6-30 11:17
估计还是内存相关问题，在确定nprocs*maxcore小于物理内存（不包括虚拟内存）的80%的情况下，减小nprocs ...

试了好些个nprocs*maxcore组合，还是不行，换成2*20000两秒就终止了。

9527253

我的配置是CPU：AMD Ryzen 9 9950X 16-Core Processor，
内存：
               total        used        free      shared  buff/cache   available
Mem:            62Gi       1.6Gi        59Gi       9.0Mi       1.6Gi        60Gi
Swap:           30Gi          0B        30Gi
磁盘：
文件系统                   容量  已用  可用 已用% 挂载点                                                                                                                                                                             
devtmpfs                    31G     0   31G    0% /dev                                                                                                                                                                              
tmpfs                       32G     0   32G    0% /dev/shm                                                                                                                                                                           
tmpfs                       13G  9.9M   13G    1% /run                                                                                                                                                                              
efivarfs                   128K   70K   54K   57% /sys/firmware/efi/efivars                                                                                                                                                 1.17.13  
/dev/mapper/rl_bogon-root   70G   28G   43G   40% /                                                                                                                                                                                 
/dev/nvme1n1p2             960M  763M  198M   80% /boot
/dev/nvme0n1p3             952G  9.5G  943G    1% /data
/dev/mapper/rl_bogon-home  852G   37G  815G    5% /home
/dev/nvme1n1p1             599M  7.7M  592M    2% /boot/efi
tmpfs                      6.3G   44K  6.3G    1% /run/user/1000