请教如何构建用于粗粒度模拟的脂质体模型

Eianghuan · 发表于 Post on yesterday 20:59

请教各位老师和大佬，学生的课题涉及到模拟脂质体穿越细胞膜的膜融合过程，需要构建一个由DOPC，DOPE，DOTAP以及DSPE-PEG共同构成的脂质体。我首先尝试了Charmm-Gui的martini构建器，但这个构建器中缺少DOTAP和DSPE-PEG的单体，因此没法构建。我后面又尝试了使用insane和TS2CG，都没能构建成球形的脂质体。

想请教老师们指一条明路

student0618 · 发表于 Post on yesterday 21:03

试试packmol调一调radius建模，有pdb格式分子就可以，拓朴另外处理

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[GROMACS] 请教如何构建用于粗粒度模拟的脂质体模型