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计算化学公社

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[GROMACS] 模拟水系锌离子电解液,其中包括一些有机小分子,力场用GAFF2,水模型可以选择什么

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在审稿人认可的前提下,水模型有什么选择?是都可以,只是精度和模拟时长的问题吗?

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A Student

2#
发表于 Post on 2026-7-2 17:43:48 | 只看该作者 Only view this author
一般目的可参考下文

一篇迄今几乎所有水模型精度的横测文章(JCIM,2021)
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 9&fromuid=64740
(出处: 计算化学公社)

特殊目的如水合物、结冰等例外。
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-7-2 18:17:20 | 只看该作者 Only view this author
student0618 发表于 2026-7-2 17:43
一般目的可参考下文

一篇迄今几乎所有水模型精度的横测文章(JCIM,2021)

好的,非常有用,多谢

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4#
发表于 Post on yesterday 13:20 | 只看该作者 Only view this author
这里面Zn2+用的什么参数呢。

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5#
发表于 Post on yesterday 13:42 | 只看该作者 Only view this author
maoxinxina 发表于 2026-7-21 13:20
这里面Zn2+用的什么参数呢。

Merz

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Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on yesterday 17:33 | 只看该作者 Only view this author

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