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[GROMACS] GAFF力场下FSI-阴离子二面角等相关参数如何查找?

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各位老师,我用sobtop生成FSI-阴离子的itp文件后发现Bond、angles和dihedrals都出现了缺失(missing and simply guessed),请问到哪里查找或下载相关参数?
以下是具体缺失的参数
[ bonds ]
;  atom_i   atom_j  functype      r0 (nm)    k (kJ/mol/nm^2)
     1        7         1        0.160605     2.500000E+05     ; F-S (f-sy) missing and simply guessed
     2        3         1        0.154400     3.799909E+05     ; N-S, prebuilt n2-sy
     2        7         1        0.154400     3.799909E+05     ; N-S, prebuilt n2-sy
     3        4         1        0.146600     4.125424E+05     ; S-O, prebuilt o-sy
     3        5         1        0.146600     4.125424E+05     ; S-O, prebuilt o-sy
     3        6         1        0.160613     2.500000E+05     ; S-F (sy-f) missing and simply guessed
     7        8         1        0.146600     4.125424E+05     ; S-O, prebuilt o-sy
     7        9         1        0.146600     4.125424E+05     ; S-O, prebuilt o-sy

[ angles ]
;  atom_i   atom_j   atom_k  functype    a0 (Deg.)  k (kJ/mol/rad^2)
     3        2        7         1       122.260      5.000000E+02     ; S-N-S (sy-n2-sy) missing and simply guessed
     2        3        4         1       123.530      5.824128E+02     ; N-S-O, prebuilt n2-sy-o
     2        3        5         1       123.530      5.824128E+02     ; N-S-O, prebuilt n2-sy-o
     2        3        6         1       102.914      5.000000E+02     ; N-S-F (n2-sy-f) missing and simply guessed
     4        3        5         1       121.410      6.066800E+02     ; O-S-O, prebuilt o-sy-o
     4        3        6         1       105.570      1.681968E+02     ; O-S-F, prebuilt f-sy-o
     5        3        6         1       105.570      1.681968E+02     ; O-S-F, prebuilt f-sy-o
     1        7        2         1       102.928      5.000000E+02     ; F-S-N (f-sy-n2) missing and simply guessed
     1        7        8         1       105.570      1.681968E+02     ; F-S-O, prebuilt f-sy-o
     1        7        9         1       105.570      1.681968E+02     ; F-S-O, prebuilt f-sy-o
     2        7        8         1       123.530      5.824128E+02     ; N-S-O, prebuilt n2-sy-o
     2        7        9         1       123.530      5.824128E+02     ; N-S-O, prebuilt n2-sy-o
     8        7        9         1       121.410      6.066800E+02     ; O-S-O, prebuilt o-sy-o

[ dihedrals ] ; propers
;  atom_i   atom_j   atom_k   atom_l  functype   d0 (Deg.)   k (kJ/mol/rad^2)    ; Case of functype=2
;  atom_i   atom_j   atom_k   atom_l  functype  phase (Deg.)  kd (kJ/mol) pn     ; Case of functype=9
     1        7        2        3         9         0.000       0.00000    1     ; F-S-N-S (f-sy-n2-sy) missing
     3        2        7        8         9         0.000       0.00000    1     ; S-N-S-O (sy-n2-sy-o) missing
     3        2        7        9         9         0.000       0.00000    1     ; S-N-S-O (sy-n2-sy-o) missing
     4        3        2        7         9         0.000       0.00000    1     ; O-S-N-S (o-sy-n2-sy) missing
     5        3        2        7         9         0.000       0.00000    1     ; O-S-N-S (o-sy-n2-sy) missing
     6        3        2        7         9         0.000       0.00000    1     ; F-S-N-S (f-sy-n2-sy) missing

[ pairs ] ; Yielded based on rotatable dihedrals
;  atom_i   atom_j  functype
     1        3         1     ; F-S-N-S
     3        8         1     ; S-N-S-O
     3        9         1     ; S-N-S-O
     4        7         1     ; O-S-N-S
     5        7         1     ; O-S-N-S
     6        7         1     ; F-S-N-S

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发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
FSI-是较常见阴离子,早就有大量文章做过涉及它的动力学,用文章里现成的参数就完了(google学术搜索诸如FSI- anion molecular dynamics)。此离子的模拟在本论坛之前也有过讨论,首页google框搜索
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