求助关于gmx输出的氢键index，中间一列全是-1，是不是bug？

azero

gmx hbond-legacy ，[ hbonds_Protein-MOL ]中间一列全是-1，是不是bug？我记得以前不是这样的，装回老版本太费尽力
我记得是三个原子的？

sobereva

如果输入的命令本身没问题，那就是bug
本论坛里有好多预编译的不同版本的gromacs windows版都可以尝试

GROMACS的原生Windows版的编译和安装方法（支持GPU加速）
http://sobereva.com/458（http://bbs.keinsci.com/thread-11848-1-1.html）

以及
• Gromacs 2022.6 GPU加速版：http://bbs.keinsci.com/thread-38865-1-1.html
• 2024.3 GPU加速版：http://bbs.keinsci.com/thread-48313-1-1.html
• 2024.4 GPU加速版：http://bbs.keinsci.com/thread-51249-1-1.html
• 2024.6 GPU加速版：http://bbs.keinsci.com/thread-56765-1-1.html
• 2025.1 GPU加速版：http://bbs.keinsci.com/thread-52322-1-1.html
• 2025.6 GPU加速版：http://bbs.keinsci.com/thread-59048-1-1.html
• 2026.1 GPU加速版：http://bbs.keinsci.com/thread-58443-1-1.html、http://bbs.keinsci.com/thread-58617-1-1.html
• WSL2-Ubuntu下运行的2024.3 GPU加速版：http://bbs.keinsci.com/thread-51360-1-1.html

azero

sobereva 发表于 2026-7-6 00:33
如果输入的命令本身没问题，那就是bug
本论坛里有好多预编译的不同版本的gromacs windows版都可以尝试

对哦，用windows版本就不愁了，谢谢SOB老师