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[波函数分析求助] ELF判断键类型有没有相对标准?

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发表于 2017-5-27 15:49:27 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 hzfish 于 2017-5-27 15:49 编辑

看到社长博文“AIM键临界点处电子密度拉普拉斯值符号判断相互作用类型失败原因的图形分析”,了解相互作用类型为两:
(1)共价作用,文献也用shared
(2)闭壳层相互作用,比如离子键、氢键、卤键、二氢键、pi-pi堆积之类


问题:
1. 相互作用类型判据有多种,就ELF而言,判断相互作用类型,ELF有没有大致的数值区间?下图中是文献给出的数值区间,这么判断依据是什么?
2. 文献也用shared interaction和closed interaction表示,共价作用是不是和shared interaction意义一样?
3. LOL判断相互作用类型是没有大致的数值区间?


20170527114826.png

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发表于 2017-5-28 05:14:51 | 显示全部楼层
无论是ELF和LOL,一般没有明确的数值区间,基本上你用[0,1]的色彩刻度来作填色图,你若能看到两个原子之间有红色或黄色区域(或标准可以更降低一点,有黄绿色区域),就可以说两个原子间有共价作用。你的图中就是,Ce和N之间有黄色作用。

共价作用和shared interaction意义一样
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 楼主| 发表于 2017-5-28 13:40:44 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2017-5-28 05:14
无论是ELF和LOL,一般没有明确的数值区间,基本上你用[0,1]的色彩刻度来作填色图,你若能看到两个原子之间 ...

谢谢社长。

有没有相互作用类型分类的测试集,测试一下。

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发表于 2017-5-29 05:12:06 | 显示全部楼层
hzfish 发表于 2017-5-28 13:40
谢谢社长。

有没有相互作用类型分类的测试集,测试一下。

目前没有
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发表于 2017-5-29 09:21:16 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2017-5-28 05:14
无论是ELF和LOL,一般没有明确的数值区间,基本上你用[0,1]的色彩刻度来作填色图,你若能看到两个原子之间 ...

Sob老师,原来看过Bader在2009年JPCA上那篇文章Bond paths are not chemical bonds, 按Bader的意思,AIM理论里面各种的概念并不应该和传统化学键框架下的概念一一对应,但是如果只从AIM理论的框架下思考问题,如何界定各种原子间的相互作用呢?

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发表于 2017-5-29 11:03:05 | 显示全部楼层
rtransformation 发表于 2017-5-29 09:21
Sob老师,原来看过Bader在2009年JPCA上那篇文章Bond paths are not chemical bonds, 按Bader的意思,AIM ...


AIM里主要靠分析原子间的BCP的属性讨论相互作用,有很多人提出不同的判断标准
AIM框架里也可以通过源函数、计算盆之间DI、考察键径上函数变化等方式讨论,但用得较少
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 楼主| 发表于 2017-5-29 13:56:47 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2017-5-29 11:03
AIM里主要靠分析原子间的BCP的属性讨论相互作用,有很多人提出不同的判断标准
AIM框架里也可以通过源 ...

判断有不同的标准,当结论不一致时,就难以选择用哪种标准讨论问题了。

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发表于 2017-5-29 18:19:08 | 显示全部楼层
hzfish 发表于 2017-5-29 13:56
判断有不同的标准,当结论不一致时,就难以选择用哪种标准讨论问题了。

没有哪一种方法总是合适的,总能找到失败的反例
需要结合多种判断指标综合讨论
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