packmol软件在已有的体系上在特定区域如何添加分子

downpuor

各位老师好，我想在进行了一段时间模拟后生成的文件md.pdb基础上，在特定的区域添加分子该如何实现。例如要添加的分子为AAA和BBB，我的已有md.pdb盒子大小大约为5*5*7nm，我想在这个盒子z方向0-3nm处添加BBB，在3-7nm处添加AAA。我的思路是将md.pdb限制在特定区域后，再添加AAA和BBB分子，但显示我的限制不正确，同时尝试了删除fixed或者insidebox的田间，要么依旧显示限制不正确要么就是长时间循环，我该如何改进呢？
tolerance 2.0
add_box_sides 1.2
filetype pdb
output mix.pdb

structure md.pdb
  number 1
   fixed 0. 0. 0.
   inside box 0. 0. 0. 50. 50. 70.
end structure

structure AAA.pdb
  number  60
   inside box 0. 0. 30. 50. 50. 70.
end structure

structure BBB.pdb
  number  30
   inside box 0. 0. 0. 50. 50. 30.
end structure

sobereva

要步步为营，最基础的成功了再试更复杂的，诸如依次尝试：
1 只添加md.pdb
2 插入一个BBB
3 插入30个BBB
4 插入一个AAA
5 插入60个AAA
每个成功之前别干下一步

另外我也不知道md.pdb是什么样，如果都没足够的真空区可以插入那么多AAA和BBB，自然无法成功