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[新手求助] 请教过渡金属配合物催化中自由能计算方法

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楼主
请教各位老师专家,对含Cu的过渡金属配合物催化的反应,计算各中间体和过渡态的自由能,采用下列方法和步骤:
1. opt+freq用 PBE0-D3(BJ)/def2-SVP (Cu用SDD),结合 scrf=solvent=dichloromethane,得到优化的结构和自由能校正量G(correction);
2. 高精度气相单点能 用PBE0-D3(BJ)/def2-TZVP ,得到 E(gas);
3. M052X/6-31g* (Cu用SDD) ,再算气相单点能,得到 E(gas,m052x)  //考虑到Cu是2配位,没有被有机部分充分包围,因此对Cu单独使用SDD赝势基组
4. M052X/6-31g* (Cu用SDD),结合SMD溶剂模型 scrf=(smd,solvent=dichloromethane),再算溶液中单点能,得到E(sol,m052x)
最后用 G(correction) + E(gas) + E(sol,m052x) - E(gas,m052x) + 1.89 kcal/mol 得到各物质的自由能,来绘制反应路径,
请教各位老师专家,上述方法是否合理?谢谢!

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2#
发表于 Post on 2026-7-14 12:55:46 | 只看该作者 Only view this author
没必要那么折腾,直接参考下文的方式计算溶剂下的自由能就完了
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html

对于过渡金属配合物,并没有文章证明M05-2X/6-31G*是结合SMD计算溶解自由能的首选,因此没必要刻意专门在这个级别计算溶解自由能。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-7-14 13:22:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-7-14 12:55
没必要那么折腾,直接参考下文的方式计算溶剂下的自由能就完了
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子 ...

感谢社长,去学习一下

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