[GROMACS] GROMACS计算分子间相互作用能时14能量项异常求助

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发表于 Post on 3 hour ago | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励

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我的体系包含十条聚合物链（PM6），200个共轭小分子(L8-BO），20000个溶剂分子，我用最后10ns模拟的轨迹分析聚合物链与共轭小分子的相互作用能，但是最后在分析14作用时，PM6-PM6的14作用能为0，但是PM6-L8BO之间的14作用能却非常大，但是分子间的14作用能不应该严格为0吗，这是什么原因呢？

计算结果

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