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[新手求助] 考察一类取代基不同的分子的BLA/BOA时原子路径是否要一致

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各位老师好,在学习了使用Multiwfn计算Bond length/order alternation (BLA/BOA)和考察键长、键级、键角、二面角随键序号的变化 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元之后,想知道如果要考察一类只有取代基不同的分子的BLA和BOA,并且想要把BLA/BOA结果放在一起进行对比以此考察取代基的影响,那么此时要考察的原子路径是否要一致?是不是一致才有可比性?

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发表于 Post on 6 day ago | 只看该作者 Only view this author
我不知道“不同的分子”具体指什么,没结构没法准确回答
只能说如果为了可比性尽可能强,路径取得能多相似就多相似
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 az¥ 于 2026-8-3 09:18 编辑
sobereva 发表于 2026-7-31 00:36
我不知道“不同的分子”具体指什么,没结构没法准确回答
只能说如果为了可比性尽可能强,路径取得能多相似 ...

谢谢老师的回复,我的分子结构就是以下这副图中的结构,对比它们之间的共轭强度,需要保持原子链一致吗C:\Users\2293898603\Desktop\STRUCTURE.tiff

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发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
az¥ 发表于 2026-8-3 09:17
谢谢老师的回复,我的分子结构就是以下这副图中的结构,对比它们之间的共轭强度,需要保持原子链一致吗

共轭强度没有唯一定义,当前这些体系也没有足够相似性(尤其是并环和非并环的情况差异很大),至少用BLA/BOA判断不妥。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-8-3 16:33
共轭强度没有唯一定义,当前这些体系也没有足够相似性(尤其是并环和非并环的情况差异很大),至少用BLA/ ...

老师,那我用相同的原子路径来判断它们的 deviation to planar,如果偏离平面的程度越大说明共轭性不强,反之则较强,这样可以吗?

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发表于 Post on 前天 00:44 | 只看该作者 Only view this author
az¥ 发表于 2026-8-3 17:09
老师,那我用相同的原子路径来判断它们的 deviation to planar,如果偏离平面的程度越大说明共轭性不强, ...

对平面性的偏离只是间接证据,可以作为佐证,但如果平面性相差不太大的话,不要光用这个说事
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 楼主 Author| 发表于 Post on 前天 09:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-8-4 00:44
对平面性的偏离只是间接证据,可以作为佐证,但如果平面性相差不太大的话,不要光用这个说事

好的,谢谢老师的解答

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 楼主 Author| 发表于 Post on 前天 09:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-8-4 00:44
对平面性的偏离只是间接证据,可以作为佐证,但如果平面性相差不太大的话,不要光用这个说事

老师,再向您请教一下,如果我想考察这些分子的共轭强弱,我应该用哪些方法呢?

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发表于 Post on 前天 23:44 | 只看该作者 Only view this author
az¥ 发表于 2026-8-4 09:55
老师,再向您请教一下,如果我想考察这些分子的共轭强弱,我应该用哪些方法呢?

没法在前提不确切的情况下说共轭强弱
要说清楚是某个环,还是某个路径,等等
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 楼主 Author| 发表于 Post on yesterday 08:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-8-4 23:44
没法在前提不确切的情况下说共轭强弱
要说清楚是某个环,还是某个路径,等等

老师,我是想考察每个分子整体结构的共轭强弱,但好像没有办法考察整体的结构,我昨天学习了您的这两篇帖子,分别是《使用Multiwfn计算AV1245指数研究大环的芳香性》(http://sobereva.com/519)和《在Multiwfn中单独考察pi电子结构特征》(http://sobereva.com/432),我可不可以计算这些分子中BODIPY核心中间的六元环和两边的五元环的AV1245指数以及整体结构的LOL-pi电子的局域特征来共同说明共轭强弱呢?

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