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[GROMACS] 利用Gromacs模拟CO2与辛烷混相问题

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最近研究了一个CO2和辛烷的混相问题,发现计算的体系压力结果总是偏大,参考着相关的文献设置,辛烷力场用的是OPLASS AA(电荷用的是1.2*CM,之前看的社长发的帖子,比较推荐的),CO2力场用的是TrappE Small力场(五点的,也是公社之前发布的),这两个力场分别单独测试了辛烷和CO2在温压下的的密度,结果误差很小;截断半径为1.4nm,NVT系综,初始模拟见下图,具体的模拟设置见附件
对于很多文献中所说,气体分子数量控制体系的压力这一说法我不太明白,我自己想的是根据加入的CO2的数量和区域体积,算出密度,再结合温度值,反算出压力;根据这个思路,我在20*5*5nm3的一半体积的盒子中加入了1045个CO2分子,温度是333K,计算出来的CO2密度应该是305.47kg/m^3,压力应该是10.23MPa左右,发现没有混相(见下图所示,辛烷的二维密度分布图),要加入2000个左右CO2才差不多混相,这远远大于已报道的最小混相压力了,不知道哪里有问题,有没有大佬帮忙解答一下


202608051022352113..png (186.16 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

辛烷二维密度分布

辛烷二维密度分布

202608051021292627..png (703.81 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

初始模型

初始模型

oil.top

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run.mdp

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C8H.itp

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C8H_ATP.itp

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