求助：Gaussian优化时报错总是报错Error in internal coordinate system

gezq · 发表于 Post on yesterday 16:32

各位老师，我在做优化时，总是报错“Error in internal coordinate system.”，加opt=cartesian关键词的话，后期总是震荡，导致不收敛。但是输出文件又没有提示具体是哪个原子之间共线了，导致不怎么怎么调整，也不知道在哪个地方添加虚原子，请问这种情况应该怎么办？

shiyong · 发表于 Post on yesterday 16:38

尝试过保存最后一步的结构再次计算吗，初猜结构合理吗。尝试过直接保存最末结构后，重新opt吗

gezq · 发表于 Post on yesterday 20:31

shiyong 发表于 2026-8-14 16:38
尝试过保存最后一步的结构再次计算吗，初猜结构合理吗。尝试过直接保存最末结构后，重新opt吗

尝试过了，初猜结构应该合理

beefly · 发表于 Post on 10 hour ago

应该是产生冗余内坐标的算法有bug，缺失了一些重要的内坐标，导致内坐标之间的重叠矩阵为病态（非零特征值小于3N-6）。找到这些内坐标（主要是键长），然后用OPT(ModRedundant)加进去就可以解决。

我曾经针对g09写过一个搜索缺失坐标的工具，没试过g16。

BDsearch.zip (180.5 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

sobereva · 发表于 Post on 8 hour ago

没具体输入输出文件没法准确说情况。opt=cartesian的时候结合高质量Hessian、小步长上限等做法最终也能搞收敛，而且还可以尝试opt=z-matrix

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