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[GROMACS] 求助:不同盒子尺寸模拟同一个电解液体系后统计溶剂化结构比例不同?

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Level 2 能力者

各位老师,我使用gromacs对丁腈BN-LiFSI电解液体系进行了模拟,但是我发现在边长为5nm(BN864个,Li+/FSI-75个)和4nm(BN443个,Li+/FSI-39个)的体系当中,虽然计算出来的锂离子与配位原子的RDF相近,但是进行分离离子对SSIP、接触离子对CIP和聚集体AGG统计分析时,结果出现了明显的差异,5nm的盒子中比例为SSIP占比: 12.34%、CIP占比:  15.60%、AGG占比:  72.06%,4nm的盒子中比例为SSIP占比: 63.77%,CIP占比:  35.76%,AGG占比:  0.47%,为什么会这样?哪一个计算结果更加可靠?

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2#
发表于 Post on 1 hour ago | 只看该作者 Only view this author
跑了多久?同一盒子有没有重复跑过?
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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