gmx版本对计算结果的影响

古与春分

各位老师，不同版本的GMX对计算结果是不是有影响啊。我两台机子，一台gmx2023.5，一台2025.2，模拟盐酸溶液在常温，50MPa下的氢键数量，共3000个分子，结果计算出的氢键数量完全不一样，一个3000左右，一个3500左右。

student0618

机器不同也有影响、随机性有影响、跑多长也有影响。
尤其是统计性质的任务，轨迹分几段分析、重跑几遍，看看采样是否足够。

abin

多搞几个副本，统计平均？