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[综合交流] 计算的ECD谱比实验的ECD谱多了一个很强的吸收峰,请教问题出在哪里

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计算的ECD谱比实验所测的ECD谱多了一个很强的吸收峰,请教大家问题出在哪里,是计算还是实验册测试的问题。
ECD谱是在甲醇中测的
计算是参照Sobereva老师的“使用Multiwfn绘制构象权重平均的光谱,http://sobereva.com/383”中2.1的方法和步骤进行,nstates=20,考虑了甲醇的溶剂效应。
谢谢!

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发表于 Post on 2017-7-6 02:53:07 | 只看该作者 Only view this author
1.计算方法是什么?
2.紫外是否吻合?
3.分子结构是什么?
起码要1,2,有3最好,否则不知道。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-6 15:18:47 | 只看该作者 Only view this author
计算过程:
(1)    通过构象搜索找到能量差在2.5 kcal/mol以内的构象14个

(2)    在B3LYP/6-31G*下进行优化,得到以下计算用的结构(去除5个重叠构象)

(3)    在B3LYP/6-31G*下做振动分析, ZPE校正因子0.9806,得到自由能校正量

(4)    在M062X/def2TZVP下做单点计算

(5)    将(2)的自由能校正量与(3)的单点能相加,根据玻尔兹曼公式计算常温下的分布比例

(6)    在PBE0/def-TZVP级别下以TDDFT方法计算最低的20个激发态,对最后所得谱图加处理权重0.69

UV和实验谱也不一致。
谢谢!

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发表于 Post on 2017-7-6 16:53:55 | 只看该作者 Only view this author
UV都不一致,ECD就不必算了,肯定对不上
先把UV算好再说

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-7 02:08:41 | 只看该作者 Only view this author
就是想请教一下,不管UV还是ECD,计算和实验谱不相符时,问题出在哪里,
是计算还是实验测试的问题,如果是计算要怎么处理?
需不需要考虑更大能量差范围内的构象?但通常后面的构象所占比例较小,应该不会有太大变化。

计算上也尝试算过10、30,50个激发态,
方法还试过:b3lyp/TZVP,cam-b3lyp/TZVP,m062x/TZVP,b3p86/TZVP;B3P86/6-311++G(2d,p),PBE1PBE/6-311++G(2d,p)
但都是结果相差更大。

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发表于 Post on 2017-7-7 06:09:49 | 只看该作者 Only view this author
注意考虑溶剂效应
考虑更大范围的构象倒没必要
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-7 11:01:08 | 只看该作者 Only view this author
这两步加了溶剂项,scrf(pcm,solvent=methanol)

(4)    在M062X/def2TZVP下做单点计算

(6)    在PBE0/def-TZVP级别下以TDDFT方法计算最低的20个激发态,对最后所得谱图加处理权重0.69

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发表于 Post on 2017-7-7 11:55:08 | 只看该作者 Only view this author
yejlyejl 发表于 2017-7-7 11:01
这两步加了溶剂项,scrf(pcm,solvent=methanol)

(4)    在M062X/def2TZVP下做单点计算

试试显式模型。
这结构氢键影响不小。

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发表于 Post on 2023-8-10 15:53:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-7-7 06:09
注意考虑溶剂效应
考虑更大范围的构象倒没必要

老师,想请教一下,这个溶剂效应应该在优化结构的时候就考虑,还是第一步优化结构以后,算TDDFT的时候再考虑就行呢

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发表于 Post on 2023-8-10 16:23:23 | 只看该作者 Only view this author
tangjinyu 发表于 2023-8-10 08:53
老师,想请教一下,这个溶剂效应应该在优化结构的时候就考虑,还是第一步优化结构以后,算TDDFT的时候再 ...

结构优化时考虑的必要性低于TDDFT考虑的必要性,但是并不是毫无必要。换句话说,当溶剂效应足够小时,结构优化考虑不考虑溶剂都是对的;当溶剂效应比较大时,结构优化必须考虑溶剂
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发表于 Post on 2023-8-10 22:26:02 | 只看该作者 Only view this author
tangjinyu 发表于 2023-8-10 15:53
老师,想请教一下,这个溶剂效应应该在优化结构的时候就考虑,还是第一步优化结构以后,算TDDFT的时候再 ...

谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html

看上文“1.3 隐式溶剂模型对体系性质的影响” 部分
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