amber如何指定残基做径向分布函数？

浅原问问 · 发表于 Post on 2017-7-14 17:06:56

老师们好，之前用amber跑完离子液体动力学后有做阳离子与阴离子之间的径向分布函数图，脚本如下。但现在想指定某两个残基，比如第21号阳离子BPY与第21号阴离子BF4之间的径向函数分布，改怎么写脚本呢？我直接加上序号并不能运行。。。

fhh2626 · 发表于 Post on 2017-7-14 17:26:46

可以载入轨迹用VMD分析

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[Amber] amber如何指定残基做径向分布函数？