计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 19774|回复 Reply: 25
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 刚接触gaussian09,请问一下高斯黑箱操作的流程,谢谢。看书实在看不懂(求助)

[复制链接 Copy URL]

29

帖子

0

威望

62

eV
积分
91

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
研一新生一枚,老师让我学习dft计算,现在下载完gaussian09和高斯view5.08,看了一些操作的手册,比如《Exploring Chemistry with Electionic Structure Method》第二页写着转自南开大学bbs网站等几本别人写的东西,但是看完了都是一个感觉,不知道写的这些东西是干嘛的怎么用,如果当概念看的话,也是能看进去的,但是看完不知道怎么使用!问过我们学校的学姐怎么使用,她告诉我说是用GView画图,选好jobtype为optimization;选好Method为TD-SCF~DFT、link0等设置好,然后用G09打开运行出out文件就是优化后的图形,也就是稳定的结构,能够使用算别的了。。再用Gv打开,再选calculate里的一些要求的频率啊,能量啊什么的,我不知道上述这些操作是不是各位前辈你们也用这种方法,怎么感觉看论坛都是发出来程序一大堆的,那个都是自己打上的吗?是不是有更好的方法进行计算,尤其是写书的这些高手写的那些入门,我理解慢还是不懂怎么用,希望能有那种计算实例一步一步的教程有的话给分享一份,提前先谢谢啦!最后唠叨一句就是新人第一次发帖,以前也没用过论坛啥的,如果哪里发的不对的地方请多多担待,我会注意的!

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2017-8-23 23:05:01 | 只看该作者 Only view this author
仔细阅读:
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355

趁着第三届科音量化初级班名额还剩一点,建议赶紧报名,省得白走弯路,误入歧途。

高斯使用没有“黑箱”。没有基本常识,则算出来的数据全都白费,毫无意义,根本发表不了,纯粹浪费人参和计算姬。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

29

帖子

0

威望

62

eV
积分
91

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-23 23:31:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-23 23:05
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355

谢谢sob老师,刚刚我仔细看了您给我发的帖子,也对咱们这个培训班挺感兴趣的,如果自己时间允许的话我一定会去的。我是做瞬态吸收的,属于实验的,但是这边的师兄都不会用gaussian,我也是问其他专业的师姐来学了点,老师就让我学dft计算也没说学这个干嘛,但是下命令了就得学好,所以我也很着急。目前我要先能做一些简单的计算就行能先给老师让我学的任务交差,比如老师给我一个分子让我去算一下什么,根据我上边说的步骤是对的吗?还有一个就是这个培训班的价格和时间在哪里能看到

29

帖子

0

威望

62

eV
积分
91

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-23 23:35:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-23 23:05
仔细阅读:
谈谈学量子化学如何正确地入门
http://sobereva.com/355

不好意思,刚刚在首页看见了培训班的内容,我考虑一下。

54

帖子

0

威望

2424

eV
积分
2478

Level 5 (御坂)

5#
发表于 Post on 2017-8-24 07:35:31 | 只看该作者 Only view this author
huaxuewuli 发表于 2017-8-23 23:35
不好意思,刚刚在首页看见了培训班的内容,我考虑一下。

一般一两天就报满,最快的半天报满,基础班我是半夜盯着通知报的,全国再找不到更好的量化培训

29

帖子

0

威望

62

eV
积分
91

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-24 08:14:27 | 只看该作者 Only view this author
目前我要先能做一些简单的计算就行能先给老师让我学的任务交差,比如老师给我一个分子让我去算一下什么,根据我上边说的步骤是对的吗?

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17221

Level 6 (一方通行)

7#
发表于 Post on 2017-8-24 09:25:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2017-8-24 09:29 编辑
huaxuewuli 发表于 2017-8-24 08:14
目前我要先能做一些简单的计算就行能先给老师让我学的任务交差,比如老师给我一个分子让我去算一下什么,根 ...

这问题问的好像说“大学委托我盖一栋楼什么的,我就是画个草图、把原材料买来,该挖的挖,该搭的搭上,最后装修一下就行了吧。”这么问没法回答、稍有基础的人也不会这么问。
给你个分子是什么分子,算一下是算什么量,考察什么问题,分子多大,计算资源有多少,想达到什么精度等等等等(这只是举例,请不要一一回答上述问题,光你一句“DFT设置好”估计就得说上几万字)。

即使知道一般步骤怎么做,还有相当大的概率会碰上坑、不懂基本的东西会完全不知道怎么解决(类比于刚会搭土楼,但一听说明天天鸽要吹过来就懵逼了)这远不是一个回帖能说完的事。

个人建议不要急功近利觉得自己折腾几天就能算出有意义的结果,如此让电脑跑了一个月还在跑死循环;或者折腾半天用了不恰当的计算级别、跑出来的结果一看就毫无意义都大有人在。

29

帖子

0

威望

62

eV
积分
91

Level 2 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-24 09:44:59 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-8-24 09:25
这问题问的好像说“大学委托我盖一栋楼什么的,我就是画个草图、把原材料买来,该挖的挖,该搭的搭上,最 ...

谢谢你的回答,我原来是学物理的,没接触过量子化学等东西,现在专业是原子分子老师也是做分子动力学的,进入实验室人家都在忙着干活我却啥都不会心里急的上火,也帮不上别人忙,我明白您说的不能急功近利,但是老师让学却没说怎么学,我基础不是很好,所以想问您一下我要把高斯先学会入门操作该怎么样学,万分感谢!

541

帖子

3

威望

6618

eV
积分
7219

Level 6 (一方通行)

9#
发表于 Post on 2017-8-24 09:51:09 | 只看该作者 Only view this author
huaxuewuli 发表于 2017-8-24 09:44
谢谢你的回答,我原来是学物理的,没接触过量子化学等东西,现在专业是原子分子老师也是做分子动力学的, ...

趁现在初级班还有少量名额,赶紧报名吧。这是一个自费都觉得无比值的培训班。4天时间所学的东西让你受益三年有余。
恍惚月余,深谙人与人之间的差距。以后还应努力学习,才能与强者比肩。

29

帖子

0

威望

62

eV
积分
91

Level 2 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-24 10:30:00 | 只看该作者 Only view this author
ABetaCarw 发表于 2017-8-24 09:51
趁现在初级班还有少量名额,赶紧报名吧。这是一个自费都觉得无比值的培训班。4天时间所学的东西让你受益 ...

主要时间上不知道老师能不能放我,有空问问

1295

帖子

0

威望

6289

eV
积分
7584

Level 6 (一方通行)

11#
发表于 Post on 2017-8-24 10:48:28 | 只看该作者 Only view this author
huaxuewuli 发表于 2017-8-24 10:30
主要时间上不知道老师能不能放我,有空问问

你放心,上过的都说好。
https://www.x-mol.com/groups/fan_jianzhong

strive for greatness

164

帖子

1

威望

2587

eV
积分
2771

Level 5 (御坂)

12#
发表于 Post on 2017-8-24 15:36:17 | 只看该作者 Only view this author
huaxuewuli 发表于 2017-8-24 10:30
主要时间上不知道老师能不能放我,有空问问

去了你就知道为什么这么多层楼过去了,还没人回答你一楼说的你那些操作行不行,正如liyuanhe211说的,有一大堆要考虑的因素,什么都不知道没办法跟你说怎么开始。参加过两次培训班的人建议你赶快和老师沟通抓紧报名,培训班超值,而且很可能一两天就满了。
如果你一个月内着急想随便算算的话,那就是先用gaussview画结构,保存gjf文件,设置chk,设置计算资源,设置任务关键词,然后运行,至于运行出来的结果怎么分析,三言两语就没法说清楚了。
人丑就该多读书,嘴拙最好少说话。
行百里者半于九十,戒骄戒躁。

1171

帖子

7

威望

6860

eV
积分
8171

Level 6 (一方通行)

13#
发表于 Post on 2017-8-24 21:43:59 | 只看该作者 Only view this author
exploring这本书有英文原版的吧?看南开大学那个干啥。。。

要是连这本书你都不知道在干什么的话就赶紧去报名吧=.=

131

帖子

1

威望

2497

eV
积分
2648

Level 5 (御坂)

14#
发表于 Post on 2017-8-25 15:00:33 | 只看该作者 Only view this author
我觉得楼主还是去报名参加初级班吧。。。
我老师不出钱,我都自费报的。。。

97

帖子

0

威望

448

eV
积分
546

Level 4 (黑子)

15#
发表于 Post on 2017-8-26 10:43:33 | 只看该作者 Only view this author
我来给你点儿自己的看法吧,我到我们课题组的时候小老板(密度泛函小卒yjcmwgk)说你第一件事儿就是看完Exploring Chemistry with Electionic Structure Method。我用两个月的时间稀里糊涂的看完了,说实话作为菜鸟(我当时会计算一些简单东西,但是对于科研毫无帮助)我还是属于一脸懵逼的状态。然后我就被定下了课题,开始通过计算化学公社里Sobereva老师的耐心解答和liyuanhe211等兄弟姐妹的帮助下,我开始知道该做些什么,应该如何做,怎么做是错误的并且必须避免的(在了解计算化学公社以前,我计算用的就是Sobereva老师嗤之以鼻的6-31G基组)。当然参加培训班是最有效的方式,不过现在开学了不是假期,你还是研一那就在完成研究生课程之余研读Exploring Chemistry with Electionic Structure Method,顺便做一下里面的例子,当然第三版里面是有各种问题,不过对于新手也无伤大雅,直接动手去搞就行了。好好学研究生课程中的《量子化学》,如果你能看Levine的Quantum Chemistry当然是最佳的选择。和你的导师研究好自己的课题,根据课题在exploring中找到对应的方法,先搞起来并和课题组还有公社的老师同学们说说你遇到的具体问题。最后,一定要看文献,这是你科研中必不可少的。PS:其实看sobereva的帖子http://sobereva.com/355中写的非常清楚了,我就是说说我自己的感受吧!我能体会新手的懵懂,不过要加油啊!祝顺利

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-22 06:48 , Processed in 0.267217 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list