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[辅助/分析程序] VEDA4软件计算的简振模式数量与高斯计算的不同,如何一一对应进行指认?

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VEDA4软件计算的简振模式数量与高斯计算的不同,如何一一对应进行指认?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-24 16:18:55 | 只看该作者 Only view this author
之前做个7分子尿素的振动模式指认,高斯计算的振动模式数量与VEDA是相同的,而这次却这样了,不知道如何处理啊?

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发表于 Post on 2017-8-24 23:04:50 | 只看该作者 Only view this author
好歹把啥分子,有几个原子说一下啊;另外,图里有几个振动模式,先帮我们数一下,说差几个,每个人都去数一遍实在太累了。
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发表于 Post on 2017-8-25 01:53:12 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2017-8-24 23:04
好歹把啥分子,有几个原子说一下啊;另外,图里有几个振动模式,先帮我们数一下,说差几个,每个人都去数一 ...


后来在群里给他回复了,是因为有些原子在opt freq时候用-1设了冻结所致。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2017-8-25 10:12:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-25 01:53
后来在群里给他回复了,是因为有些原子在opt freq时候用-1设了冻结所致。

原来如此,谢谢!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-25 11:06:21 | 只看该作者 Only view this author
现在新问题又来了,用之前opt+freq得出的机构重新算freq,取消冻结,结果出现了好多虚频,之前opt+freq用了opt=(tight,calcall)  ultrafine   nosymm 等关键字,那做频率分析的时候有该如何设置呢?

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发表于 Post on 2017-8-25 14:31:38 | 只看该作者 Only view this author
zhyho00824 发表于 2017-8-25 11:06
现在新问题又来了,用之前opt+freq得出的机构重新算freq,取消冻结,结果出现了好多虚频,之前opt+freq用了 ...

用了冻结,必然优化不到极小点,有虚频是很正常的,原理上也没法避免
优化时用了ultrafine则振动分析必须用。其它关键词在freq时候不用涉及。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-25 20:17:29 | 只看该作者 Only view this author
那这样的话,岂不是不能用VEDA来做振动归属了,这该如何是好呢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-25 20:35:44 | 只看该作者 Only view this author
还是说带着虚频直接去分析呢?

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发表于 Post on 2017-8-25 21:20:48 | 只看该作者 Only view this author
带着限制条件去优化除了确实是计算一个不是基态的构型的情况,一般是怕系统自由优化的时候费时费力,如果确信最后优化的结构应该具有限制条件那样的信息,就带着限制条件优化之后,去掉限制条件再优化一下,这时可能原子位置会有些微调。但基本没有大的改变。计算都是有误差的,比如理想的状态二面角是90度,但优化的能量最低态可能是89.99。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-25 21:26:21 | 只看该作者 Only view this author
好的,我试试看!

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