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楼主 Author: sobereva
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[超级计算机] [投票]大家是否使用超算中心资源?

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发表于 Post on 2017-5-2 10:45:04 | 只看该作者 Only view this author
在用Google Cloud,有300刀的赠金。申请开64线程的机器需要充值35刀。
64线程(2.2G Broadwell)+240GB内存的机器跑可抢占实例,300刀的赠金大概可以跑460小时。一个月按730小时算,全部在跑大概480刀。
课题组里可以每人弄一个Google 账号各搞一轮,对我们这种不做太多计算的组可以折腾相当长时间。

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发表于 Post on 2017-6-15 14:04:31 | 只看该作者 Only view this author
很多超算还在使用红帽5的操作系统,以至于不能安装GLIBC2.5及以上的库,新版本的高斯不能使用。

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发表于 Post on 2017-7-1 11:19:54 | 只看该作者 Only view this author
jiahh 发表于 2014-10-21 17:26
使用的是国家超级计算天津中心,因为节点可并行运算,运算速度要比集群和单片机快的多,美中不 ...

天津超算是2011年成立的,所以硬件可能也需要更新换代

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发表于 Post on 2017-7-5 18:27:09 | 只看该作者 Only view this author
化学势 发表于 2017-3-18 13:31
用过自己课题组的集群,也用过我们学校的超算中心(大连理工凌云超算)的刀片节点和胖节点。
性能:
刀片节 ...

请问我电脑有高斯软件,但单位的高性能计算机上没有高斯软件,这样也可以借助高性能服务计算吗?

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发表于 Post on 2017-7-18 10:11:33 | 只看该作者 Only view this author
本人新手,刚一开始上手就是用的超算,深圳超算,可能先入为主吧,个人觉得还不错

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-7-19 05:42:55 | 只看该作者 Only view this author
qcn 发表于 2017-7-5 18:27
请问我电脑有高斯软件,但单位的高性能计算机上没有高斯软件,这样也可以借助高性能服务计算吗?

你当然得服务器上也装了高斯才行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

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发表于 Post on 2017-7-19 12:20:35 | 只看该作者 Only view this author
谢谢sob老师的回复

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发表于 Post on 2017-8-15 16:31:05 | 只看该作者 Only view this author
用的天河2号,广州中心~

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发表于 Post on 2017-8-25 16:01:54 | 只看该作者 Only view this author
使用深圳超算半年,速度并没感觉很快,而且稍微大点体系计算TD单点总是出错,浪费了好多机时后改到最慢的FN分区,计算才得以进行。

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发表于 Post on 2017-10-10 17:24:17 | 只看该作者 Only view this author
此前一直使用组内的服务器,今来偶尔用了下太湖神威,虽然是测试账号,但是满足运行小于1小时的小任务的运行,符合我现在的需求。感觉除了编译VASP、Gaussian和提交任务有些不同,其他还是蛮快的,主要是队列很空,不必考虑排队。

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发表于 Post on 2017-11-6 16:37:12 | 只看该作者 Only view this author
五十八 发表于 2017-10-10 17:24
此前一直使用组内的服务器,今来偶尔用了下太湖神威,虽然是测试账号,但是满足运行小于1小时的小任务的运 ...

求问太湖之光用的什么编译器呀,openACC吗?VASP之类的是不是需要移植的

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发表于 Post on 2017-11-6 18:28:45 | 只看该作者 Only view this author
legendyao 发表于 2017-11-6 16:37
求问太湖之光用的什么编译器呀,openACC吗?VASP之类的是不是需要移植的

用的是swxxx 就是神威自己的编译器, vasp已经有人在做移植了,首批效率不高,估计第二次快出来了,另外要是自己编译的话要注意结合sw的slurm来编译,而且intel cpu版本的vasp编译也要注意不然可能无法使用并行。 另外SW现在C的适配还是最好的, VASP其实已经可以用openmp 改一改成openacc 然后不用mpi也可以的。

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发表于 Post on 2017-12-10 18:03:54 | 只看该作者 Only view this author
用过安徽大学的超算,当时是不收钱的,不过计算速度太慢,更加要命的是系统各种软硬件问题,提交的任务没有几个能一次性正常完成的,心好累。
今年10月申请中科大的超算,原因是发一篇SCI并致谢会奖励2W~20W核时,加入超算群后发现基础价格偏高(0.2/核时,校外0.3)、故障率偏高、排队比较多,兴致不大了。
目前计算主要是Sob老师推荐的淘宝服务器,2*2696V4非常舒心。
要说自己买机器不足之处也有,例如受到办公楼电线功率限制,夏天太热只能忍痛关一部分机器,需要自己维护等。

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发表于 Post on 2018-1-10 19:36:09 | 只看该作者 Only view this author
请教一下sober老师,上海超算中心的设备这么样,魔方2的硬件感觉还是不错的,单个节点24核心,http://www.ssc.net.cn/resources_1.aspx
不知道sober老师有么有用过,能够给点相关建议,谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-10 20:01:11 | 只看该作者 Only view this author
yezhonghua 发表于 2018-1-10 19:36
请教一下sober老师,上海超算中心的设备这么样,魔方2的硬件感觉还是不错的,单个节点24核心,http://www.s ...

没用过。我做计算都在我自己的服务器上跑
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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